61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4680 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4680  methyltransferase type 11  100 
 
 
260 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0865  Methyltransferase type 12  36.61 
 
 
232 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2154  methyltransferase type 12  36.73 
 
 
235 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.988172  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 
208 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  24.24 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 
1340 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  24.82 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  28.15 
 
 
299 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  26.14 
 
 
233 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001055  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  28.21 
 
 
214 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.829142  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 
210 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  23.36 
 
 
306 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3318  hypothetical protein  25.34 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  30.72 
 
 
211 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  25.52 
 
 
728 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  41.67 
 
 
186 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.32 
 
 
213 aa  48.9  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1407  methyltransferase type 11  30.2 
 
 
260 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.266871  normal  0.495193 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.66 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.91 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5473  Methyltransferase type 12  25.68 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 
230 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0108  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.43 
 
 
249 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  26.25 
 
 
293 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  27.88 
 
 
330 aa  46.6  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0834  hypothetical protein  23.33 
 
 
239 aa  45.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 
258 aa  45.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  25 
 
 
263 aa  44.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  25 
 
 
263 aa  44.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  25 
 
 
263 aa  44.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  24.76 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  22.29 
 
 
457 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  29.35 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.68 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  23.96 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  23.96 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.62 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  33.77 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  24.32 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  24.84 
 
 
396 aa  43.5  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
200 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
275 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.17 
 
 
252 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
200 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
288 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  24.4 
 
 
400 aa  42.7  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  22.78 
 
 
194 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.63 
 
 
253 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  25.3 
 
 
297 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  27.91 
 
 
357 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.33 
 
 
247 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1255  Methyltransferase type 11  28.41 
 
 
154 aa  42.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.9 
 
 
239 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  43.59 
 
 
278 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.81 
 
 
247 aa  42.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.64 
 
 
254 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  43.59 
 
 
278 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.46 
 
 
249 aa  42  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.170942  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  24.62 
 
 
276 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>