30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2154 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2154  methyltransferase type 12  100 
 
 		 235 aa  477  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.988172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0865  Methyltransferase type 12  44.05 
 
 		 232 aa  204  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4680  methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  37.18 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  28.38 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  35.16 
 
 		 457 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  28.76 
 
 		 217 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 634 aa  45.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.4 
 
 		 711 aa  45.4  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2060  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.64 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000109149  unclonable  0.0000217963 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  26.32 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0716  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.67 
 
 		 406 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.719598  normal  0.139789 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 271 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.21 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  25.85 
 
 		 391 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 324 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1971  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000321939  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 353 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  27.78 
 
 		 353 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0814  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.86 
 
 		 411 aa  42.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 1523 aa  42.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0786  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.93 
 
 		 406 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0668711  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  21.29 
 
 		 391 aa  42  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1590  methyltransferase  31.82 
 
 		 219 aa  42.4  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  23.61 
 
 		 297 aa  42  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 487 aa  42  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2643  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.67 
 
 		 413 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2413  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.64 
 
 		 236 aa  41.6  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1402  Methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 394 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>