More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4209 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  59.55 
 
 
1191 aa  1386    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4552  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  59.44 
 
 
794 aa  787    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.394306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3948  aldehyde dehydrogenase family protein, putative/cytochrome c family protein, putative  62.44 
 
 
1187 aa  1460    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.564465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3930  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  56.77 
 
 
766 aa  780    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0713425  normal  0.0997312 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4332  Isoquinoline 1-oxidoreductase., Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  62.95 
 
 
1207 aa  1441    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2509  isoquinoline 1-oxidoreductase  63.35 
 
 
759 aa  851    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2517  cytochrome c, class I  46.02 
 
 
976 aa  683    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3932  isoquinoline 1-oxidoreductase  62.73 
 
 
764 aa  836    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00339818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1848  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  61.99 
 
 
780 aa  843    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0190  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  58.19 
 
 
1253 aa  1275    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4209  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  100 
 
 
1182 aa  2378    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1669  pyrroloquinoline-quinone aldehyde dehydrogenase  77.01 
 
 
1183 aa  1731    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224955  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3673  putative aldehyde dehydrogenase  59.06 
 
 
748 aa  823    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  61.62 
 
 
1215 aa  1338    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3583  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  62.18 
 
 
1187 aa  1464    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2135  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  62.03 
 
 
1187 aa  1451    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.270413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0663  isoquinoline 1-oxidoreductase  62.75 
 
 
1202 aa  1444    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80425  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6039  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  59.17 
 
 
1179 aa  1300    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0887172  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1889  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  62.18 
 
 
1187 aa  1446    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2491  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  56.01 
 
 
761 aa  776    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3488  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  58.48 
 
 
760 aa  782    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43790  putative aldehyde dehydrogenase  58.12 
 
 
748 aa  809    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.813342  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4329  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  58.52 
 
 
795 aa  786    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4037  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  58.52 
 
 
795 aa  786    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2423  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  65.13 
 
 
1181 aa  1475    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1855  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.8 
 
 
996 aa  551  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  42.32 
 
 
975 aa  538  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3137  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  45.24 
 
 
736 aa  535  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.488373  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8451  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  45.05 
 
 
740 aa  531  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60331  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0237  Isoquinoline 1-oxidoreductase  45.33 
 
 
741 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.99394  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4545  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.3 
 
 
831 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4044  cytochrome c, class I  47.05 
 
 
806 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.489703  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4322  cytochrome c, class I  47.05 
 
 
806 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3481  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.23 
 
 
795 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233456 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3374  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  42.32 
 
 
731 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.977623 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1181  twin-arginine translocation pathway signal  40.37 
 
 
746 aa  496  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2505  putative oxidoreductase, beta subunit  40.48 
 
 
756 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3005  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  42.9 
 
 
760 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43810  putative cytochrome c  60.39 
 
 
433 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3674  putative cytochrome c  61.65 
 
 
433 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  55.56 
 
 
432 aa  459  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1907  twin-arginine translocation pathway signal  41.64 
 
 
749 aa  452  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.203332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3929  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  52.58 
 
 
443 aa  425  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476483  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5703  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  36.98 
 
 
756 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.051575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5506  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.24 
 
 
754 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4956  putative aldehyde dehydrogenase  37.68 
 
 
757 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426554  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7022  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.28 
 
 
753 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35241  normal  0.158422 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6356  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  37.41 
 
 
753 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.401473  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1472  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  37.41 
 
 
753 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5820  putative aldehyde dehydrogenase  37.96 
 
 
753 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.318558  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5603  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.28 
 
 
753 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7024  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.77 
 
 
428 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263193  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6358  cytochrome c, class I  49.54 
 
 
428 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0883371  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1470  cytochrome c, class I  49.54 
 
 
428 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212518  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5504  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.07 
 
 
425 aa  399  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326388  normal  0.134115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0897  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  38.96 
 
 
713 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958278  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1905  cytochrome c, class I  49.29 
 
 
467 aa  393  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331041  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3369  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48 
 
 
432 aa  385  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5601  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.43 
 
 
426 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31055  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5818  cytochrome c, class I  47.43 
 
 
426 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4958  cytochrome c, class I  45.81 
 
 
424 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2446  twin-arginine translocation pathway signal  36.04 
 
 
745 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3088  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.65 
 
 
442 aa  360  9.999999999999999e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.161961  normal  0.0270934 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5705  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.32 
 
 
433 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.23 
 
 
429 aa  354  5e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105717  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2448  cytochrome c, class I  48.72 
 
 
424 aa  354  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157698  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3127  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.13 
 
 
728 aa  351  4e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0737433 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0201  cytochrome c, class I  43.65 
 
 
432 aa  348  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1830  cytochrome c, class I  41.8 
 
 
432 aa  345  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1183  cytochrome c, class I  46.23 
 
 
420 aa  343  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0863  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  31.35 
 
 
710 aa  308  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1932  isoquinoline 1-oxidoreductase  32.34 
 
 
715 aa  291  5.0000000000000004e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4458  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  36.43 
 
 
670 aa  291  7e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3102  molybdopterin-binding xanthine dehydrogenase  33.42 
 
 
707 aa  290  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130356  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0875  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  35.36 
 
 
698 aa  289  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.0669846 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  43.25 
 
 
497 aa  287  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  43.25 
 
 
452 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  43.25 
 
 
452 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  42.07 
 
 
425 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.99 
 
 
444 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.8 
 
 
531 aa  285  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  43 
 
 
452 aa  285  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  43 
 
 
452 aa  285  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  43 
 
 
452 aa  285  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  43 
 
 
452 aa  285  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  42.5 
 
 
492 aa  284  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41 
 
 
425 aa  283  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.09 
 
 
448 aa  283  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  41.13 
 
 
425 aa  282  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.7 
 
 
425 aa  281  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.81 
 
 
425 aa  280  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  40.81 
 
 
425 aa  280  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  40.81 
 
 
425 aa  280  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2353  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  32.5 
 
 
684 aa  280  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  41.13 
 
 
425 aa  279  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 
531 aa  278  6e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.6 
 
 
680 aa  276  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3212  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.86 
 
 
707 aa  274  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395113  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  39.1 
 
 
430 aa  274  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.27 
 
 
531 aa  273  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>