29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2246 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2246  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  293  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.01103  normal  0.0213561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3480  hypothetical protein  42.45 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2835  hypothetical protein  39.5 
 
 		 172 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0242  hypothetical protein  32.62 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0414  hypothetical protein  37.8 
 
 		 194 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7201  hypothetical protein  34.93 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1335  hypothetical protein  39.06 
 
 		 250 aa  73.9  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.59 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.5 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.25 
 
 		 279 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.77 
 
 		 286 aa  62  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.32 
 
 		 276 aa  60.5  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  28.06 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.64 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2681  hypothetical protein  29.03 
 
 		 227 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.71 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.84 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  27.27 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  37.7 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  30.17 
 
 		 413 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0124  hypothetical protein  27.42 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221822  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14861  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.12 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0740611 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07551  hypothetical protein  27.64 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.113858  normal  0.0161403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0336  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.7 
 
 		 394 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  26.47 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10671  hypothetical protein  34.62 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.06 
 
 		 213 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10671  hypothetical protein  34.62 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.134437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>