More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2058 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2058  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
457 aa  909    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.498177  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0159  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.37 
 
 
430 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0571  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.37 
 
 
430 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154303  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0419  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.39 
 
 
429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.602103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0253  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.13 
 
 
430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0444  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.02 
 
 
430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.312195  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.51 
 
 
427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0520  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.32 
 
 
430 aa  558  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121097  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.67 
 
 
427 aa  558  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.43 
 
 
421 aa  555  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.78 
 
 
427 aa  555  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4200  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.55 
 
 
427 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672348  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.99 
 
 
424 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0413  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.59 
 
 
431 aa  545  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399966  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.25 
 
 
427 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0103  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.08 
 
 
432 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.994876 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.56 
 
 
427 aa  541  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0161  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.57 
 
 
433 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.310719  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.86 
 
 
432 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.836596  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2868  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.35 
 
 
432 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3094  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.35 
 
 
432 aa  537  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3456  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.03 
 
 
428 aa  525  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3276  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.56 
 
 
429 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4218  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.45 
 
 
431 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  63.88 
 
 
427 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4728  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.27 
 
 
431 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0581  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.1 
 
 
429 aa  488  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.154304  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0060  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.29 
 
 
425 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0319  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.66 
 
 
412 aa  481  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4717  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.32 
 
 
424 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.144444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.36 
 
 
429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247409  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.27 
 
 
422 aa  463  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.89 
 
 
434 aa  455  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3804  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.43 
 
 
420 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4503  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.77 
 
 
423 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3824  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.86 
 
 
420 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3516  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.86 
 
 
420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1469  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.33 
 
 
421 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300791  normal  0.0287865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2669  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.83 
 
 
418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1084  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.74 
 
 
426 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.52 
 
 
421 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.28 
 
 
418 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.98 
 
 
423 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.74 
 
 
423 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.74 
 
 
423 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.27 
 
 
435 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.27 
 
 
435 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.48 
 
 
418 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.27 
 
 
423 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.32 
 
 
423 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.32 
 
 
458 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.08 
 
 
423 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.32 
 
 
458 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.27 
 
 
423 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.32 
 
 
458 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.32 
 
 
458 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.32 
 
 
458 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  54 
 
 
423 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.66 
 
 
421 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.9 
 
 
421 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.08 
 
 
423 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  53 
 
 
435 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.8 
 
 
418 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.18 
 
 
432 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.9 
 
 
426 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.9 
 
 
426 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0528  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.57 
 
 
429 aa  409  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  54 
 
 
423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.4 
 
 
427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.75 
 
 
423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.72 
 
 
418 aa  404  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.43 
 
 
426 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.79 
 
 
423 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.25 
 
 
426 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.32 
 
 
420 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.37 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.75 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.06 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.84 
 
 
423 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.08 
 
 
423 aa  398  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.15 
 
 
428 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.55 
 
 
425 aa  396  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.73 
 
 
421 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1548  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.85 
 
 
420 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.751317  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.44 
 
 
430 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1382  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.06 
 
 
415 aa  394  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.04 
 
 
418 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.5 
 
 
414 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.89 
 
 
418 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 
415 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.93 
 
 
419 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 
419 aa  388  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.74 
 
 
418 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.35 
 
 
421 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.08 
 
 
419 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
434 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.84 
 
 
419 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.11 
 
 
421 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.54 
 
 
423 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.81 
 
 
423 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>