40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1523 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1523  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.547199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  61.8 
 
 		 247 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  58.29 
 
 		 256 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  59.89 
 
 		 245 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1595  hypothetical protein  49.13 
 
 		 210 aa  171  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  48.55 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3125  hypothetical protein  48.9 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2280  hypothetical protein  50.29 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2626  hypothetical protein  45.28 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  49.17 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3255  hypothetical protein  49.08 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3453  hypothetical protein  48.86 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1033  hypothetical protein  41.79 
 
 		 212 aa  160  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0858  hypothetical protein  44.38 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3129  hypothetical protein  45.51 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0102671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  46.41 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2433  hypothetical protein  45.51 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0806  hypothetical protein  40.3 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3779  hypothetical protein  45.86 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0856  hypothetical protein  42.86 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.097776  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0854  hypothetical protein  42.24 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0434  hypothetical protein  43.48 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0433  hypothetical protein  38.95 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  37.25 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2862  cytochrome c class I  34.27 
 
 		 187 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  36.18 
 
 		 191 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  35.17 
 
 		 190 aa  88.2  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  36.19 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  41.25 
 
 		 484 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  41.03 
 
 		 114 aa  51.2  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0604  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 124 aa  48.5  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.24563  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  38.27 
 
 		 115 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  34.41 
 
 		 115 aa  45.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0260  monoheme cytochrome SoxX  30.84 
 
 		 174 aa  45.4  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00749516  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0917  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  36.25 
 
 		 121 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.613288  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4156  cytochrome c class I  31.67 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  32.47 
 
 		 97 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0567  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  36.25 
 
 		 120 aa  42  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000813905  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3671  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  32.29 
 
 		 135 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  31.33 
 
 		 126 aa  41.6  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>