19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3675 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3673  Allergen V5/Tpx-1 family protein  98.15 
 
 
325 aa  657    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0308491  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3675  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 
325 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3716  hypothetical protein  87.69 
 
 
310 aa  555  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3718  Allergen V5/Tpx-1 family protein  65.55 
 
 
319 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4336  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.86 
 
 
352 aa  97.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253754  normal  0.853513 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5104  Allergen V5/Tpx-1 related  29.14 
 
 
353 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217216  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2224  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.64 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  hitchhiker  0.00516568 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5207  SCP-like extracellular  27.21 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1542  SCP-like extracellular  27.21 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312767  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5022  SCP-like extracellular  27.18 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0390932  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5427  SCP-like extracellular  26.83 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4490  allergen V5/Tpx-1-like protein  27.46 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5562  SCP-like extracellular  29.45 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.249089 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6555  SCP-like extracellular  29.6 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4607  Allergen V5/Tpx-1 related  25.58 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398633  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2049  hypothetical protein  31.51 
 
 
466 aa  53.9  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1504  hypothetical protein  26.89 
 
 
396 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.890142  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  29.29 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1485  periplasmic protein  35.05 
 
 
459 aa  46.6  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>