72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2908 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  100 
 
 		 423 aa  831    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  54.2 
 
 		 448 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  53.59 
 
 		 440 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  31.9 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  27.34 
 
 		 428 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  27.54 
 
 		 422 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  29.92 
 
 		 428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  25.49 
 
 		 421 aa  147  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 421 aa  147  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 421 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 421 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 421 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  25.24 
 
 		 421 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  25.24 
 
 		 421 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  29.97 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  30.24 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  30.24 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  30.24 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  29.97 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  29.97 
 
 		 425 aa  137  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 427 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3509  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 214 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36765  normal  0.167547 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0338  MFS transporter  23.1 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0543879  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1586  major facilitator superfamily permease  23.85 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000240166  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2823  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 207 aa  72  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0138  hypothetical protein  21.35 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1682  hypothetical protein  36.27 
 
 		 123 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1681  hypothetical protein  35.06 
 
 		 103 aa  55.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1683  hypothetical protein  35.62 
 
 		 82 aa  53.5  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  22.84 
 
 		 454 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  22.84 
 
 		 454 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0137  hypothetical protein  21.69 
 
 		 497 aa  53.5  0.000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  23.08 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 454 aa  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  24.73 
 
 		 447 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  25.37 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  24.54 
 
 		 463 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.28 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  26.75 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1213  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  23.67 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  26.12 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  26.42 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  26.69 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  23.45 
 
 		 458 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3079  MFS family transporter  26.11 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1616  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  22.86 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  28.68 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  32.95 
 
 		 489 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 437 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  26.01 
 
 		 412 aa  43.5  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  34.09 
 
 		 552 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0241  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0694015 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 431 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  32.95 
 
 		 527 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 447 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 409 aa  43.1  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  32.95 
 
 		 496 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  28.68 
 
 		 455 aa  43.1  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>