More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2143 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2143  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
365 aa  748    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3258  phosphonate metabolism-associated iron-containing alcohol dehydrogenase  66.85 
 
 
401 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.423792  normal  0.216617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2411  phosphonate metabolism-associated iron-containing alcohol dehydrogenase  54.08 
 
 
362 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2551  Iron-containing alcohol dehydrogenase  43.77 
 
 
380 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2733  putative alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
410 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0334328  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  36.21 
 
 
387 aa  159  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1237  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
412 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  33.65 
 
 
381 aa  156  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1042  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
441 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1428  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 
441 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0048  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0244255  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.52 
 
 
419 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549318  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 
382 aa  153  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.54 
 
 
382 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.97 
 
 
382 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 
382 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0007  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.87 
 
 
359 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  31.66 
 
 
382 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0007  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
359 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
395 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
383 aa  150  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
399 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.22 
 
 
394 aa  149  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.67 
 
 
384 aa  149  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.33 
 
 
400 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2478  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.25 
 
 
395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  28.26 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  28.26 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0177  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000105782  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.3 
 
 
382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  28.26 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  28.26 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  28.26 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  28.26 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38750  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.18 
 
 
382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1048  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 
395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
400 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2043  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
858 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.19 
 
 
398 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30 
 
 
382 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.27 
 
 
382 aa  146  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.33 
 
 
400 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.9 
 
 
387 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.33 
 
 
400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.86 
 
 
382 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.86 
 
 
382 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 
392 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  33.02 
 
 
382 aa  145  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1495  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  30.16 
 
 
863 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1888  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 
361 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
387 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
382 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.43 
 
 
376 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0443  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.61 
 
 
858 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  31.86 
 
 
382 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1552  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.12 
 
 
391 aa  144  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  35.02 
 
 
872 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2250  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 
387 aa  144  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0702  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.08 
 
 
386 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
402 aa  143  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 
397 aa  143  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2296  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
428 aa  143  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000281941  hitchhiker  0.000367197 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3121  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
387 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00478821  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
386 aa  142  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
382 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1083  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
381 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.458923  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3303  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
387 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2682  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.36 
 
 
387 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3080  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.36 
 
 
387 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  29 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  28.92 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
382 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0139  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
869 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.880882  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0134  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
869 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.32 
 
 
387 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.03 
 
 
387 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 
387 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0389  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.63 
 
 
869 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.69 
 
 
400 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.23 
 
 
383 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
390 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.81 
 
 
395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  27.95 
 
 
383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  27.67 
 
 
383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.16 
 
 
387 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
390 aa  140  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 
385 aa  140  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
402 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>