24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0177 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0177  PilT domain-containing protein  100 
 
 
135 aa  265  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.872264  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1224  PilT protein domain protein  50.78 
 
 
141 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13700  PIN domain protein  32.59 
 
 
140 aa  94  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2306  PilT domain-containing protein  43.59 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.131604 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0698  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0887  PilT domain-containing protein  34.33 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631126  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2577  hypothetical protein  30.83 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5555  PilT protein domain protein  33.07 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0123  PilT protein domain protein  34.85 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0236  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 
136 aa  80.1  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0119  hypothetical protein  30.83 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0483151  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0099  PilT protein domain protein  31.3 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  30.88 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0300  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.372415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0026  PilT protein domain protein  27.27 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0366  PilT domain-containing protein  29.01 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.732059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1184  PIN domain protein, putative  33.57 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2141  PilT protein domain protein  31.11 
 
 
154 aa  60.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.976499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4811  Phycobilisome protein  26.83 
 
 
306 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11160  hypothetical protein  27.94 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2686  PilT protein domain protein  23.13 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0266  hypothetical protein  27.01 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.041266  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1173  PilT domain-containing protein  24.09 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0475965  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26830  hypothetical protein  28.21 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>