More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5876 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5876  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
268 aa  547  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6159  enoyl-CoA hydratase  76.83 
 
 
258 aa  394  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1532  enoyl-CoA hydratase  52 
 
 
254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.383816  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1562  enoyl-CoA hydratase  54.8 
 
 
254 aa  263  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  49.2 
 
 
253 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3752  enoyl-CoA hydratase  44.8 
 
 
256 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 
257 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1562  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1436  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
269 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185731  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2158  enoyl-CoA hydratase  38.27 
 
 
261 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
257 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
258 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
257 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
258 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
258 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
259 aa  149  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
261 aa  148  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4618  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.9 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
262 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
264 aa  146  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
258 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
258 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
258 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
258 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.82 
 
 
262 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2352  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 
253 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0605839  normal  0.0748288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
260 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
260 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 
260 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
260 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
258 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 
263 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  37.26 
 
 
262 aa  141  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.83 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.2 
 
 
275 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
260 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
257 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3826  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
257 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.51 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.16 
 
 
659 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2604  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.888828  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.18 
 
 
651 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
262 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 
270 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.86 
 
 
661 aa  133  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
262 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
258 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
262 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 
262 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 
267 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
260 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
256 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
258 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.13 
 
 
662 aa  132  6e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
275 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.92 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2803  enoyl-CoA hydratase  34.3 
 
 
248 aa  131  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72856  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 
262 aa  131  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  33.73 
 
 
663 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13583  enoyl-CoA hydratase  36.93 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5068  enoyl-CoA hydratase  35.22 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.3 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.33 
 
 
662 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4769  enoyl-CoA hydratase  35.22 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0532353  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4683  enoyl-CoA hydratase  35.22 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  31.18 
 
 
258 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>