More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4848 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1160  ABC transporter, ATP-binding protein  69.82 
 
 
503 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1002  ABC transporter  71.01 
 
 
503 aa  682    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4848  ABC transporter related  100 
 
 
510 aa  1004    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4233  ABC transporter related  65.5 
 
 
513 aa  617  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235353  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4348  ABC transporter related  56.08 
 
 
499 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  44.95 
 
 
527 aa  355  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  40.55 
 
 
509 aa  351  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  42.86 
 
 
527 aa  351  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  38.58 
 
 
502 aa  342  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  40.12 
 
 
503 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  39.01 
 
 
513 aa  341  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 
534 aa  340  5e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  42.69 
 
 
534 aa  339  7e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  42.01 
 
 
532 aa  338  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  40.53 
 
 
508 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  38.11 
 
 
510 aa  333  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  42.89 
 
 
504 aa  332  7.000000000000001e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  41.89 
 
 
505 aa  332  8e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  39.2 
 
 
509 aa  332  1e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  39.68 
 
 
547 aa  332  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  39.76 
 
 
491 aa  330  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  40 
 
 
510 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  40.36 
 
 
524 aa  330  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  38.76 
 
 
507 aa  327  3e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.7 
 
 
508 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  40.48 
 
 
516 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  38.99 
 
 
509 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  41.83 
 
 
551 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 
511 aa  325  9e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  40.64 
 
 
541 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  37.89 
 
 
511 aa  324  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  37.94 
 
 
510 aa  323  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2114  ABC transporter related protein  37.33 
 
 
506 aa  323  5e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  37.65 
 
 
509 aa  323  5e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
510 aa  322  7e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.55 
 
 
510 aa  322  7e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  40.92 
 
 
545 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 
523 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
510 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  40.63 
 
 
558 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  37.7 
 
 
509 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
510 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 
522 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  39.72 
 
 
511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  40.63 
 
 
514 aa  320  3e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1446  ABC transporter-related protein  39.02 
 
 
514 aa  320  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  40.55 
 
 
527 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.68 
 
 
528 aa  320  3e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  37.12 
 
 
511 aa  320  5e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.72 
 
 
506 aa  320  5e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.35 
 
 
510 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.35 
 
 
510 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.35 
 
 
511 aa  318  1e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  41.2 
 
 
534 aa  318  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0533  ABC transporter related protein  41.41 
 
 
509 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  40.23 
 
 
604 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  38.94 
 
 
520 aa  316  6e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.35 
 
 
510 aa  316  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  37.12 
 
 
514 aa  316  7e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  37.67 
 
 
518 aa  316  8e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.35 
 
 
510 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  36.33 
 
 
520 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  41.22 
 
 
505 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  40.28 
 
 
533 aa  313  2.9999999999999996e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  36.33 
 
 
510 aa  313  4.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0922  ATPase  39.59 
 
 
502 aa  313  6.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.213196  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0562  ABC transporter-related protein  41.31 
 
 
546 aa  312  7.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.136503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05400  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  41.98 
 
 
517 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  40.83 
 
 
518 aa  312  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  38.81 
 
 
511 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  41.17 
 
 
514 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.45 
 
 
512 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4194  ABC transporter related  40.04 
 
 
515 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  39.41 
 
 
515 aa  310  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1498  ATPase  36.87 
 
 
513 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1182  ABC transporter related  37.08 
 
 
512 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1529  ABC transporter related  37.2 
 
 
513 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  40.2 
 
 
503 aa  307  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0296  ABC transporter related  36.63 
 
 
510 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000067661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  39.33 
 
 
525 aa  306  6e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  39.88 
 
 
506 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0633  ABC transporter related  38.13 
 
 
518 aa  304  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000912545 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  40.75 
 
 
498 aa  303  4.0000000000000003e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1076  ABC transporter related  34.94 
 
 
515 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0403178  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  40.32 
 
 
529 aa  301  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl668  ribose ABC transporter ATP-binding component  34.97 
 
 
511 aa  301  1e-80  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  38.29 
 
 
503 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  38.29 
 
 
503 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  36.03 
 
 
528 aa  301  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  34.96 
 
 
509 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0860  ABC transporter related  39.23 
 
 
511 aa  301  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0483579 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0561  ABC transporter related protein  37.7 
 
 
506 aa  300  6e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3233  ABC transporter related  41.03 
 
 
500 aa  299  7e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.405741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  39.19 
 
 
532 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  40.37 
 
 
512 aa  298  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  34.39 
 
 
507 aa  297  3e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1270  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 
507 aa  297  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0726  ABC transporter related  36.47 
 
 
538 aa  296  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  37.16 
 
 
510 aa  295  9e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  38.91 
 
 
517 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>