50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4461 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4461  hypothetical protein  100 
 
 		 1057 aa  1757    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.481101  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5314  Putative membrane protein involved in toxin uptake  73.87 
 
 		 944 aa  220  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  32.26 
 
 		 309 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  26.58 
 
 		 333 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  30.83 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2082  hypothetical protein  36.94 
 
 		 1703 aa  61.6  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112234 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  36.7 
 
 		 214 aa  61.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2985  hypothetical protein  31.11 
 
 		 318 aa  60.1  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  28.32 
 
 		 336 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  28.32 
 
 		 336 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  29.89 
 
 		 268 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  30.18 
 
 		 862 aa  56.6  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  30.88 
 
 		 517 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  29.23 
 
 		 264 aa  54.7  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3343  hypothetical protein  32.5 
 
 		 309 aa  54.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  26.47 
 
 		 312 aa  53.9  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  32.76 
 
 		 386 aa  54.3  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 369 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  32.35 
 
 		 521 aa  53.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  34.68 
 
 		 213 aa  52.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  34.43 
 
 		 299 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  28.82 
 
 		 788 aa  52.4  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  32.29 
 
 		 216 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  29.39 
 
 		 489 aa  51.6  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.93 
 
 		 1795 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  38.22 
 
 		 2105 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  28.94 
 
 		 332 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  32.58 
 
 		 204 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  30.64 
 
 		 745 aa  50.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10771  hypothetical protein  36.67 
 
 		 241 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.870639 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  27.08 
 
 		 1000 aa  49.3  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  28.77 
 
 		 576 aa  48.9  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  32.56 
 
 		 286 aa  48.9  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 		 227 aa  48.5  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4974  hypothetical protein  40.38 
 
 		 259 aa  48.5  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4679  hypothetical protein  40.38 
 
 		 268 aa  48.5  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.869824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4591  hypothetical protein  40.38 
 
 		 255 aa  48.5  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 493 aa  48.1  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.38 
 
 		 222 aa  48.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  34.36 
 
 		 1033 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  29.14 
 
 		 182 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  30.19 
 
 		 294 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1580  hypothetical protein  38.46 
 
 		 243 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5176  hypothetical protein  34.95 
 
 		 244 aa  47  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  28.97 
 
 		 351 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  32.32 
 
 		 225 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  28.02 
 
 		 340 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  27.68 
 
 		 215 aa  45.8  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  36.08 
 
 		 973 aa  45.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  36.02 
 
 		 184 aa  44.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>