More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3941 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  65.11 
 
 		 494 aa  660    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  100 
 
 		 495 aa  973    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  76.47 
 
 		 495 aa  770    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  68.31 
 
 		 490 aa  656    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1034  xanthine permease  75.66 
 
 		 495 aa  748    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581901  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1277  uracil-xanthine permease  68.89 
 
 		 496 aa  673    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3917  uracil-xanthine permease  66.88 
 
 		 493 aa  638    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1113  uracil-xanthine permease  75.66 
 
 		 495 aa  747    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0781  putative permease transmembrane protein  63.3 
 
 		 533 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.654089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1307  xanthine permease  66.6 
 
 		 499 aa  581  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.225701  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3292  uracil-xanthine permease  60.41 
 
 		 463 aa  519  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  60.08 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  56.07 
 
 		 468 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  55.8 
 
 		 482 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  56.13 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  56.38 
 
 		 465 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  56.13 
 
 		 466 aa  501  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  60.04 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  56.58 
 
 		 457 aa  498  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  58.04 
 
 		 469 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  55.95 
 
 		 457 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  56.58 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  56.78 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  55.95 
 
 		 479 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  57.2 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  56.78 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  56.58 
 
 		 457 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  55.95 
 
 		 457 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  56.99 
 
 		 458 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  57.2 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  55.85 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  54.12 
 
 		 469 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  57.62 
 
 		 469 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  56.37 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  54.05 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  53.75 
 
 		 468 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  49.28 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  49.69 
 
 		 482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  49.69 
 
 		 482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  49.69 
 
 		 482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  49.69 
 
 		 482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  49.69 
 
 		 482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  51.05 
 
 		 463 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  49.69 
 
 		 525 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  49.69 
 
 		 482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  49.48 
 
 		 525 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  50.21 
 
 		 463 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  49.49 
 
 		 475 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  49.49 
 
 		 475 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  48.81 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  48.28 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  47.62 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  45.68 
 
 		 489 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  45.27 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  45.27 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  45.47 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  42.74 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  42.11 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  44.02 
 
 		 452 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  45.73 
 
 		 451 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  44.66 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  44.66 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  45.25 
 
 		 463 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  43.7 
 
 		 444 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  43.45 
 
 		 640 aa  353  4e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  44.66 
 
 		 451 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  40.5 
 
 		 446 aa  353  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  41.24 
 
 		 503 aa  352  7e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  41.6 
 
 		 825 aa  352  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  42.21 
 
 		 501 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0633  xanthine/uracil transporter  39.92 
 
 		 457 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  42.11 
 
 		 506 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  41.24 
 
 		 665 aa  343  5e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3606  xanthine permease  40.49 
 
 		 457 aa  343  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  41.03 
 
 		 505 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  41.24 
 
 		 509 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  40.42 
 
 		 440 aa  340  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  41.14 
 
 		 440 aa  339  7e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  41.14 
 
 		 440 aa  339  7e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  40.21 
 
 		 440 aa  339  8e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  40.21 
 
 		 440 aa  339  9e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3080  xanthine/uracil permease  42.59 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  40.92 
 
 		 440 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  40.92 
 
 		 440 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  40.92 
 
 		 440 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  40.92 
 
 		 440 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  41.12 
 
 		 487 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  40.92 
 
 		 440 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  41.74 
 
 		 485 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  41.24 
 
 		 505 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  42.98 
 
 		 633 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  41.03 
 
 		 505 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  40.82 
 
 		 505 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  40.55 
 
 		 440 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  38.73 
 
 		 647 aa  324  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  39.34 
 
 		 493 aa  324  3e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  38.7 
 
 		 497 aa  322  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3433  xanthine/uracil permease  38.57 
 
 		 451 aa  320  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4724  xanthine permease  38.89 
 
 		 518 aa  319  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0102171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  41.28 
 
 		 500 aa  319  7e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>