259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2544 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 273 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  84.76 
 
 		 271 aa  427  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  79.85 
 
 		 272 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4771  hypothetical protein  79.5 
 
 		 241 aa  367  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.838718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2670  hypothetical protein  75 
 
 		 270 aa  350  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  63.4 
 
 		 266 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  63.02 
 
 		 282 aa  292  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  65.2 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2787  hypothetical protein  62.45 
 
 		 272 aa  275  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.770752  normal  0.86011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  54.33 
 
 		 266 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  51.95 
 
 		 265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  52.38 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  53.68 
 
 		 265 aa  234  9e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  48.41 
 
 		 263 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0632  hypothetical protein  48.71 
 
 		 272 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.818176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  49.79 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  50 
 
 		 263 aa  221  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  49.79 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  46.55 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4342  hypothetical protein  56.13 
 
 		 274 aa  219  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  48.28 
 
 		 265 aa  216  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1097  hypothetical protein  53.25 
 
 		 263 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  48.05 
 
 		 265 aa  215  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  52.48 
 
 		 268 aa  214  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  47.94 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1178  hypothetical protein  46.36 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  49.79 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  51.14 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  43.64 
 
 		 264 aa  208  8e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  43.64 
 
 		 268 aa  208  8e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  47.64 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  49.59 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  46.67 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  50.21 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  49.79 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  47.24 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  48.28 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  46.96 
 
 		 269 aa  198  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  44.9 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  47.5 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  45.53 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  44.08 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  42.58 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1245  hypothetical protein  47.48 
 
 		 266 aa  191  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  42.42 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  42.86 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  42.86 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  42.86 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2201  hypothetical protein  49.3 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000468231  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  44.16 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  41.22 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1825  protein of unknown function DUF81  47.91 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2424  protein of unknown function DUF81  47.44 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  46.73 
 
 		 263 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  40.16 
 
 		 268 aa  178  8e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  40.54 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  38.31 
 
 		 274 aa  171  9e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  38.7 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  45.7 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  38.49 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  41.13 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  43.25 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  43.09 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  38.17 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1023  hypothetical protein  44.53 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  42.19 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  42.19 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  41.02 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  41.02 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  40.62 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1040  hypothetical protein  39.76 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  40.8 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3041  hypothetical protein  41.8 
 
 		 266 aa  153  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  0.785978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  43.37 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  37.41 
 
 		 272 aa  152  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  41.18 
 
 		 263 aa  152  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3127  protein of unknown function DUF81  40.62 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.156153  normal  0.596117 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  40.27 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  38.63 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  37.77 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  41.71 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  40.73 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1333  hypothetical protein  42.15 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2177  hypothetical protein  39.46 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00465003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1144  hypothetical protein  41.02 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001494  hypothetical protein  34.83 
 
 		 268 aa  142  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696729  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1134  hypothetical protein  40.31 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  37.86 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1153  hypothetical protein  41.67 
 
 		 269 aa  139  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  36.48 
 
 		 267 aa  138  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  37.93 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  39.34 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1051  hypothetical protein  41.89 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2053  hypothetical protein  38.36 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4460  hypothetical protein  40.71 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2938  hypothetical protein  37.95 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.436865 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  34.62 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  35.71 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0864  protein of unknown function DUF81  40.07 
 
 		 272 aa  126  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0611  hypothetical protein  35.74 
 
 		 294 aa  125  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>