31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1317 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 138 aa  286  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4426  hypothetical protein  55.88 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0430646  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1696  hypothetical protein  30.43 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.661261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  37.5 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2145  hypothetical protein  27.05 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  31.75 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  31.75 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  31.75 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2529  hypothetical protein  27.13 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  25.95 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  27.01 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10142  hypothetical protein  48.94 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1423  Limonene-12-epoxide hydrolase  37.18 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  27.78 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  27.78 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  27.78 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2898  ketosteroid isomerase-like protein  33.9 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  25.35 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1210  ketosteroid isomerase-like protein  30.14 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.187179  normal  0.389634 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1969  hypothetical protein  25.58 
 
 		 141 aa  43.5  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  28.46 
 
 		 359 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  31.07 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3634  protein of unknown function DUF1486  36.96 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1777  hypothetical protein  41.38 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1469  hypothetical protein  36.73 
 
 		 175 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1640  hypothetical protein  32 
 
 		 138 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0534707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  26.5 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  22.52 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4520  hypothetical protein  25.2 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38212  normal  0.255709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3358  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  28.75 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>