30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0590 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0590  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  393  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4529  hypothetical protein  40.69 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0512  hypothetical protein  33.51 
 
 		 227 aa  88.6  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3244  hypothetical protein  36.36 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0741047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3895  hypothetical protein  35.89 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  30.26 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  29.95 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0271  LemA protein  31.41 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.497624  hitchhiker  0.00615451 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  26.67 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  24.57 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  24.34 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  24.21 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  24.34 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  24.34 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  27.86 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  40 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  21.03 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  28.09 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  28.49 
 
 		 183 aa  45.1  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  27.68 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  29.47 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  27.55 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  28.79 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  22.99 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  28.35 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4005  LemA family protein  26.63 
 
 		 186 aa  42  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000752628 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  23.62 
 
 		 202 aa  42  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  29.38 
 
 		 195 aa  42  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  45.65 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  29.9 
 
 		 184 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>