More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0355 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  100 
 
 		 427 aa  868    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  69.74 
 
 		 402 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  68.95 
 
 		 402 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  69.17 
 
 		 402 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  68.9 
 
 		 402 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  67.56 
 
 		 402 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  67.9 
 
 		 404 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  66.84 
 
 		 403 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  62.8 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  62.11 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  61.84 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  62.11 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  62.11 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  62.11 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  62.13 
 
 		 402 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  60.59 
 
 		 400 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  59.79 
 
 		 400 aa  472  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  43.77 
 
 		 396 aa  296  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  43.21 
 
 		 397 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  37.87 
 
 		 401 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  38.38 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  38.68 
 
 		 403 aa  225  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  40.26 
 
 		 412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  37.97 
 
 		 395 aa  219  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  37.1 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  36.34 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  35.98 
 
 		 413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  35.88 
 
 		 416 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  38.35 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  36.09 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  36.29 
 
 		 397 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  35.66 
 
 		 398 aa  203  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  34.09 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  36.29 
 
 		 402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  35.81 
 
 		 414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  36.71 
 
 		 395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  34.26 
 
 		 398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  34.76 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  35.73 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  35.62 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  34.65 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  34.66 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  34.61 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  35.18 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  34.54 
 
 		 399 aa  190  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  37.73 
 
 		 394 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  36.46 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  35.41 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  35.05 
 
 		 406 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  33.66 
 
 		 384 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  34.26 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  33.77 
 
 		 391 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  33.25 
 
 		 404 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  33.99 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  34.67 
 
 		 444 aa  180  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  33.92 
 
 		 389 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  32.65 
 
 		 385 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  33.25 
 
 		 406 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  33.5 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  34.44 
 
 		 400 aa  172  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  29.97 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  33.7 
 
 		 402 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  30.48 
 
 		 408 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  35.51 
 
 		 420 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  29.97 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  33.08 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  33.81 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  29.72 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  27.75 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  29.26 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  34.01 
 
 		 373 aa  153  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.39 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  31.49 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  32.75 
 
 		 391 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  32.75 
 
 		 391 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  34.32 
 
 		 385 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  34.32 
 
 		 385 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  34.34 
 
 		 385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.84 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  34.02 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.5 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  32.75 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  31.1 
 
 		 382 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  30.79 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  32.69 
 
 		 389 aa  145  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  30.63 
 
 		 382 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  31.21 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  31.33 
 
 		 410 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  31.12 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  31 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  31.04 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  33.63 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  29.06 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04576  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01950)  28.27 
 
 		 459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.669089  normal  0.45987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  33.05 
 
 		 404 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  28.09 
 
 		 711 aa  136  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  32.78 
 
 		 405 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  30.09 
 
 		 385 aa  136  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  31.82 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>