More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2298 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
289 aa  570  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  80.6 
 
 
299 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  79.38 
 
 
289 aa  411  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  73.1 
 
 
289 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  68.61 
 
 
251 aa  325  6e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  68.14 
 
 
255 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  68.02 
 
 
252 aa  318  9e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  67.7 
 
 
249 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  68.95 
 
 
252 aa  315  5e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  66.37 
 
 
253 aa  315  7e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  67.11 
 
 
248 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  66.96 
 
 
255 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  66.52 
 
 
255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  66.67 
 
 
248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  62.24 
 
 
261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  64.85 
 
 
249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  67.42 
 
 
255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  65.49 
 
 
248 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  63.2 
 
 
247 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  66.67 
 
 
251 aa  311  9e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  63.91 
 
 
248 aa  311  9e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  63.91 
 
 
248 aa  311  9e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  67.26 
 
 
251 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  63.91 
 
 
248 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  65.47 
 
 
247 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  66.22 
 
 
250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  64.6 
 
 
248 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  64.6 
 
 
248 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  64.6 
 
 
248 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  64.6 
 
 
248 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  66.52 
 
 
251 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  65.32 
 
 
250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  54.04 
 
 
280 aa  306  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  66.06 
 
 
251 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  62.33 
 
 
245 aa  297  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  63.51 
 
 
262 aa  292  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  62.9 
 
 
253 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1331  flagellar biosynthetic protein FliP  59.07 
 
 
247 aa  271  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.7654  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0484  flagellar biosynthesis protein FliP  61.26 
 
 
246 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.016254  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  57.85 
 
 
250 aa  265  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1753  flagellar biosynthesis protein FliP  59.03 
 
 
249 aa  261  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1753  flagellar biosynthesis protein FliP  59.03 
 
 
249 aa  261  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1168  flagellar biosynthetic protein FliP  59.31 
 
 
256 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.655036  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  54.63 
 
 
253 aa  258  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0740  flagellar biosynthesis protein FliP  62.5 
 
 
252 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  55.2 
 
 
249 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  52.26 
 
 
246 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  55.51 
 
 
264 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  53.68 
 
 
253 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  53.68 
 
 
253 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  53.68 
 
 
253 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  53.62 
 
 
281 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  55.95 
 
 
262 aa  256  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  55.61 
 
 
253 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  55.61 
 
 
253 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  54.42 
 
 
279 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0978  flagellar biosynthesis protein FliP  60.75 
 
 
250 aa  256  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  0.0315075 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  55 
 
 
249 aa  255  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  55.16 
 
 
253 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  55 
 
 
249 aa  255  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  53.98 
 
 
277 aa  255  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  55.61 
 
 
276 aa  254  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  55.41 
 
 
253 aa  254  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  55.16 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001180  flagellar biosynthesis protein FliP  58.88 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.985929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  55.16 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0217  flagellar biosynthesis protein FliP  55.5 
 
 
278 aa  252  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359414  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  52.84 
 
 
262 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04967  flagellar biosynthesis protein FliP  57.94 
 
 
255 aa  251  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  55.4 
 
 
250 aa  250  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  54.46 
 
 
252 aa  249  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  51.93 
 
 
254 aa  249  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  57.08 
 
 
253 aa  248  9e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  55.2 
 
 
265 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  51.8 
 
 
253 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2957  flagellar biosynthesis protein FliP  53.81 
 
 
274 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  53.7 
 
 
262 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  56.04 
 
 
247 aa  246  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  54.55 
 
 
301 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1698  flagellar biosynthesis protein FliP  54.55 
 
 
301 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  55.56 
 
 
247 aa  245  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  55.81 
 
 
251 aa  245  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  55.81 
 
 
251 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  54.93 
 
 
251 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  53.52 
 
 
261 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2302  flagellar biosynthesis protein FliP  55.61 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2402  flagellar biosynthesis protein FliP  55.61 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  55.14 
 
 
254 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  55.4 
 
 
255 aa  242  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0245  flagellar biosynthesis protein FliP  52.91 
 
 
250 aa  242  5e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  48.31 
 
 
260 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0710  flagellar biosynthesis protein FliP  62.61 
 
 
274 aa  241  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.823404  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  50.44 
 
 
245 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  50.44 
 
 
245 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  50.44 
 
 
245 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  52.29 
 
 
222 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  50.44 
 
 
245 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2195  flagellar biosynthesis protein FliP  50.44 
 
 
245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  59.79 
 
 
223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1965  flagellar biosynthesis protein FliP  56.34 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>