59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06887 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06887  protoporphyrinogen  100 
 
 		 129 aa  267  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1394  hypothetical protein  55.88 
 
 		 530 aa  124  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  30.53 
 
 		 506 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  30.53 
 
 		 506 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  31.11 
 
 		 499 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  32.56 
 
 		 484 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  30.49 
 
 		 506 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  34.15 
 
 		 594 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  31.43 
 
 		 482 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  34.15 
 
 		 594 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  34.15 
 
 		 594 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  30.23 
 
 		 486 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2308  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 570 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231532  normal  0.0778846 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  32.86 
 
 		 490 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  51.22 
 
 		 609 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  32.86 
 
 		 490 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  30.23 
 
 		 486 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2295  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 578 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  32.86 
 
 		 489 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  32.86 
 
 		 488 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  30.23 
 
 		 484 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2030  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 577 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  34.12 
 
 		 565 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04110  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01002)  32.61 
 
 		 492 aa  44.3  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  51.35 
 
 		 453 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  35.21 
 
 		 423 aa  43.5  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  34.62 
 
 		 989 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  51.35 
 
 		 453 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1936  glutamate synthase subunit beta  37.93 
 
 		 491 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  61.11 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  32.86 
 
 		 479 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  30.23 
 
 		 478 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  32.89 
 
 		 647 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  32.89 
 
 		 647 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  35.9 
 
 		 624 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  33.78 
 
 		 511 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  34.29 
 
 		 432 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  37.93 
 
 		 491 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  32.88 
 
 		 471 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2280  putative oxidoreductase  50 
 
 		 412 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  40 
 
 		 477 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02034  hypothetical protein  50 
 
 		 412 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02075  predicted oxidoreductase  50 
 
 		 412 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  38.46 
 
 		 477 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0825  putative oxidoreductase  50 
 
 		 412 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1502  putative oxidoreductase  50 
 
 		 412 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  40 
 
 		 477 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1512  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50 
 
 		 412 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3278  putative oxidoreductase  50 
 
 		 412 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.598108 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0185  glutamate synthase subunit beta  37.93 
 
 		 491 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  29.41 
 
 		 484 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0728  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 		 570 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0404381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2356  hypothetical protein  51.52 
 
 		 972 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0503  glutamate synthase subunit beta  37.93 
 
 		 492 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114994  normal  0.266316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2309  hypothetical protein  51.52 
 
 		 972 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  32.86 
 
 		 483 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2348  hypothetical protein  51.52 
 
 		 972 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284959 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  38.81 
 
 		 441 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  36.49 
 
 		 455 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>