More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000989 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000989  oligopeptide transport ATP-binding protein OppF  100 
 
 
310 aa  643    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5784  ABC transporter related  53.9 
 
 
299 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0699295 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03427  hypothetical protein  58.4 
 
 
331 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002582  (GlcNAc)2 ABC transporter ATP-binding component 2  58.78 
 
 
331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2072  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.24 
 
 
348 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0237279  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6688  ABC transporter related  51.95 
 
 
299 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157267  normal  0.337888 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0145  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  57.25 
 
 
331 aa  310  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2393  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.57 
 
 
347 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2741  ABC transporter related  51.3 
 
 
309 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.871465  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2580  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 
331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5672  ABC transporter related  52.16 
 
 
314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0549  ABC oligopeptide/dipeptide transporter ATP-binding protein  55.21 
 
 
328 aa  295  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.824636  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3794  ABC transporter related  54.58 
 
 
377 aa  288  8e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0402  ABC transporter related  52.87 
 
 
374 aa  286  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0245246  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34890  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  53.46 
 
 
289 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1679  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.42 
 
 
347 aa  268  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0042  ABC transporter related  52.69 
 
 
267 aa  268  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 
311 aa  266  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.59 
 
 
311 aa  265  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.59 
 
 
311 aa  265  8e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0900  ABC transporter-related protein  43.27 
 
 
311 aa  265  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0155747  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2724  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.48 
 
 
353 aa  263  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.632529 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 
311 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 
311 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 
311 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 
311 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 
311 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  43.27 
 
 
311 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 
311 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6185  ABC transporter related  50.39 
 
 
285 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1484  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
376 aa  261  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  0.667215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2623  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  49.24 
 
 
338 aa  261  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.675572  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1182  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47 
 
 
333 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.637692  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0760  ABC transporter related  43.13 
 
 
311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2513  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.31 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.313855  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0931  ABC transporter related protein  48.11 
 
 
265 aa  251  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0988  ABC transporter related  42.72 
 
 
313 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1007  ABC transporter related  42.72 
 
 
313 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.18 
 
 
629 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1616  ABC transporter related protein  41.85 
 
 
311 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.35 
 
 
649 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0845  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.97 
 
 
358 aa  249  4e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.692378  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.18 
 
 
629 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0211  hypothetical protein  46.21 
 
 
332 aa  249  5e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0202  hypothetical protein  46.21 
 
 
332 aa  249  5e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.58 
 
 
632 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1333  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.04 
 
 
343 aa  248  7e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 
627 aa  248  8e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  41.31 
 
 
623 aa  248  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1401  ABC transporter related  46.95 
 
 
291 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  45.39 
 
 
630 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3992  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.68 
 
 
360 aa  246  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.777078  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  42.12 
 
 
640 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1847  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  46.21 
 
 
368 aa  245  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.693751  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  43.51 
 
 
610 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12500  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.96533  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.39 
 
 
633 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0152  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 
310 aa  243  3e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.07 
 
 
634 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.75 
 
 
633 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.07 
 
 
634 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.77 
 
 
632 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.75 
 
 
633 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.07 
 
 
634 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  42.07 
 
 
633 aa  242  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1120  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.53 
 
 
350 aa  242  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.667973  decreased coverage  0.00637132 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  42.99 
 
 
629 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.09 
 
 
619 aa  241  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  40.38 
 
 
619 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  41.8 
 
 
640 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.89 
 
 
633 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.7 
 
 
326 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.7 
 
 
326 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.04 
 
 
329 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.91 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0559  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.6 
 
 
340 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.98385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.58 
 
 
631 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.77 
 
 
625 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1914  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 
321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.212102  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.4 
 
 
321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 
423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302511  normal  0.155474 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5630  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.44 
 
 
328 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7460  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  47.19 
 
 
317 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.12 
 
 
625 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.12 
 
 
643 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01350  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.88 
 
 
286 aa  237  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1854  ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase  40.45 
 
 
664 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  48.09 
 
 
566 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1552  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.27 
 
 
324 aa  237  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5910  peptide ABC transporter ATP-binding protein  43.94 
 
 
339 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0678087  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2852  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.48 
 
 
323 aa  237  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1530  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.12 
 
 
343 aa  237  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  41.75 
 
 
625 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0325  putative ATP-binding ABC transporter protein  40.13 
 
 
685 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  42.26 
 
 
601 aa  236  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.32 
 
 
349 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  40.19 
 
 
623 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  39.87 
 
 
623 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  40.19 
 
 
623 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  40.38 
 
 
613 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>