216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1785 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 361 aa  717    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  85.47 
 
 		 363 aa  622  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  82.63 
 
 		 373 aa  602  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004166  flagellar P-ring protein FlgI  87.77 
 
 		 278 aa  498  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  66.2 
 
 		 363 aa  481  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  66.57 
 
 		 368 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  65.19 
 
 		 363 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  66.01 
 
 		 363 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  66.29 
 
 		 363 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  65.19 
 
 		 363 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  65.19 
 
 		 363 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  65.19 
 
 		 363 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  65.28 
 
 		 363 aa  477  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  63.26 
 
 		 363 aa  474  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  65.35 
 
 		 363 aa  471  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  63.99 
 
 		 363 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  65.8 
 
 		 363 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  63.35 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  63.64 
 
 		 364 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  63.16 
 
 		 363 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  62.43 
 
 		 370 aa  460  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  62.5 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1484  flagellar basal body P-ring protein  63.2 
 
 		 363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.313129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  60.61 
 
 		 365 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  63.76 
 
 		 379 aa  438  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  60.28 
 
 		 386 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  60.06 
 
 		 369 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  59.78 
 
 		 369 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  60.86 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  60.06 
 
 		 371 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  59.78 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  59.5 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  57.73 
 
 		 362 aa  414  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  59.78 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  60.58 
 
 		 380 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  59.22 
 
 		 369 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  60.4 
 
 		 369 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  60.4 
 
 		 369 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  55.49 
 
 		 367 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  55.03 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  54.47 
 
 		 376 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  53.08 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  54.17 
 
 		 372 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  55.65 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  54.17 
 
 		 372 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1231  flagellar basal body P-ring protein  52.23 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1231  flagellar basal body P-ring protein  52.23 
 
 		 367 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  53.26 
 
 		 374 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 		 371 aa  349  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0513  flagellar basal body P-ring protein  50.42 
 
 		 371 aa  342  4e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164737  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1712  flagellar basal body P-ring protein  49.44 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405686  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  48.76 
 
 		 378 aa  338  8e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  47.38 
 
 		 364 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  50.27 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0076  flagellar basal body P-ring protein  48.87 
 
 		 371 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.322423  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  50.55 
 
 		 365 aa  334  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  48.73 
 
 		 367 aa  333  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0220  flagellar basal body P-ring protein  47.22 
 
 		 391 aa  332  8e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0646  flagellar basal body P-ring protein  47.77 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3571  flagellar basal body P-ring protein  45.88 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  46.99 
 
 		 370 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  50.57 
 
 		 377 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2914  flagellar basal body P-ring protein  48.33 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  49.31 
 
 		 377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  48.91 
 
 		 392 aa  325  7e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  48.86 
 
 		 369 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0062  flagellar basal body P-ring protein  47.75 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0068  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 376 aa  319  5e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3964  flagellar basal body P-ring protein  47.19 
 
 		 370 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2005  flagellar basal body P-ring protein  49.19 
 
 		 369 aa  316  4e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2418  flagellar basal body P-ring protein  49.19 
 
 		 369 aa  316  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.097185  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2317  flagellar basal body P-ring protein  49.19 
 
 		 369 aa  316  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3066  flagellar basal body P-ring protein  47.34 
 
 		 384 aa  315  6e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.405902  normal  0.219474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4428  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 388 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3461  flagellar basal body P-ring protein  46.59 
 
 		 372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  49 
 
 		 372 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  49 
 
 		 372 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  48.58 
 
 		 392 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01076  flagellar P-ring protein precursor I  46.99 
 
 		 365 aa  311  9e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2566  flagellar P-ring protein  46.99 
 
 		 365 aa  311  9e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01084  hypothetical protein  46.99 
 
 		 365 aa  311  9e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.981614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1203  flagellar basal body P-ring protein  46.99 
 
 		 365 aa  311  9e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2520  flagellar basal body P-ring protein  46.99 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1203  flagellar basal body P-ring protein  46.99 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0939901  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1459  flagellar basal body P-ring protein  46.72 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.31008  hitchhiker  0.000149159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1875  flagellar basal body P-ring protein  47.53 
 
 		 369 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0270  flagellar basal body P-ring protein  47.93 
 
 		 371 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.830393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2048  flagellar basal body P-ring protein  47.27 
 
 		 365 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.159552  normal  0.112526 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  46.09 
 
 		 391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  46.09 
 
 		 391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  47.14 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  46.09 
 
 		 391 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  48.58 
 
 		 367 aa  309  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1293  flagellar basal body P-ring protein  47.35 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.160652  hitchhiker  0.00453741 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4678  flagellar P-ring protein  45.3 
 
 		 374 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218644 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2007  flagellar basal body P-ring protein  47.35 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0317412  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2191  flagellar basal body P-ring protein  47.35 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000395183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1278  flagellar basal body P-ring protein  47.35 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286836 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1249  flagellar basal body P-ring protein  47.35 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.392186 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0191  flagellar basal body P-ring protein  45.3 
 
 		 387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.774706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>