216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2191 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1249  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 365 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.392186 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2007  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 365 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0317412  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2191  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 365 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000395183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1278  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 365 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1293  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 365 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.160652  hitchhiker  0.00453741 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01076  flagellar P-ring protein precursor I  92.33 
 
 		 365 aa  621  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2566  flagellar P-ring protein  92.33 
 
 		 365 aa  621  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1459  flagellar basal body P-ring protein  92.05 
 
 		 365 aa  621  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.31008  hitchhiker  0.000149159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2048  flagellar basal body P-ring protein  92.05 
 
 		 365 aa  620  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.159552  normal  0.112526 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1203  flagellar basal body P-ring protein  92.33 
 
 		 365 aa  621  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2520  flagellar basal body P-ring protein  92.33 
 
 		 365 aa  621  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1203  flagellar basal body P-ring protein  92.33 
 
 		 365 aa  621  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0939901  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01084  hypothetical protein  92.33 
 
 		 365 aa  621  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.981614  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1594  flagellar basal body P-ring protein  90.5 
 
 		 358 aa  599  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2963  flagellar basal body P-ring protein  80.44 
 
 		 366 aa  552  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.863915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2418  flagellar basal body P-ring protein  79.33 
 
 		 369 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.097185  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2317  flagellar basal body P-ring protein  79.33 
 
 		 369 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2005  flagellar basal body P-ring protein  79.33 
 
 		 369 aa  548  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2591  flagellar basal body P-ring protein  81.09 
 
 		 369 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1875  flagellar basal body P-ring protein  79.55 
 
 		 369 aa  544  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1560  flagellar basal body P-ring protein  78.71 
 
 		 369 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.750011  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1532  flagellar basal body P-ring protein  72.33 
 
 		 369 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.760833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  62.85 
 
 		 392 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  63.32 
 
 		 394 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  61.52 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  63.23 
 
 		 369 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  62.95 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  62.03 
 
 		 392 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  61.99 
 
 		 390 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  61.52 
 
 		 391 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  62.95 
 
 		 392 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  61.52 
 
 		 391 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  63.59 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  63.59 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  63.03 
 
 		 401 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  63.59 
 
 		 401 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  63.59 
 
 		 400 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  63.59 
 
 		 400 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  63.59 
 
 		 401 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  63.59 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  62.09 
 
 		 377 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  58.36 
 
 		 377 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  60.46 
 
 		 369 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2955  flagellar basal body P-ring protein  62.2 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.468199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  61.33 
 
 		 374 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0147  flagellar basal body P-ring protein  61.81 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  58.45 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  59.44 
 
 		 372 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  59.44 
 
 		 372 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3787  flagellar basal body P-ring protein  61.62 
 
 		 395 aa  391  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  58.29 
 
 		 385 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  57.35 
 
 		 368 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  57.14 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  54.77 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3066  flagellar basal body P-ring protein  58.45 
 
 		 384 aa  363  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.405902  normal  0.219474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  53.41 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4428  flagellar basal body P-ring protein  56.98 
 
 		 388 aa  360  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0562  flagellar basal body P-ring protein  55.84 
 
 		 385 aa  360  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  52.44 
 
 		 401 aa  352  8e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  50 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  50.69 
 
 		 386 aa  346  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0756  flagellar basal body P-ring protein  58.4 
 
 		 364 aa  346  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 376 aa  345  6e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 		 369 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 		 369 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  51 
 
 		 362 aa  344  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 		 371 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  50.41 
 
 		 369 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  48.76 
 
 		 376 aa  342  5.999999999999999e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  50.41 
 
 		 369 aa  342  8e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  49.73 
 
 		 372 aa  340  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  47.55 
 
 		 379 aa  337  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3835  flagellar basal body P-ring protein  54.42 
 
 		 374 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  50.57 
 
 		 369 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  50.57 
 
 		 369 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  48.19 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3108  flagellar basal body P-ring protein  54.13 
 
 		 374 aa  333  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.043594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  48.91 
 
 		 372 aa  332  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  48.91 
 
 		 372 aa  332  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  49.01 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  48.62 
 
 		 363 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  49.3 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  48.33 
 
 		 365 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  47.91 
 
 		 373 aa  318  6e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  45.88 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  45.36 
 
 		 364 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0270  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 		 371 aa  308  9e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.830393 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3364  flagellar basal body P-ring protein  49.59 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1484  flagellar basal body P-ring protein  47.22 
 
 		 363 aa  306  5.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.313129  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  47.21 
 
 		 364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  45.75 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  47.85 
 
 		 363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  46.88 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  45.6 
 
 		 363 aa  300  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0220  flagellar basal body P-ring protein  45.94 
 
 		 391 aa  300  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  44.09 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  45.98 
 
 		 370 aa  297  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  45.15 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0646  flagellar basal body P-ring protein  45.38 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>