28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1740 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  655    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2418  hypothetical protein  31.65 
 
 
313 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3060  hypothetical protein  31.42 
 
 
301 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726847  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2524  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 
289 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.824242  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1722  hypothetical protein  36.09 
 
 
309 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3147  hypothetical protein  25.08 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3231  hypothetical protein  31 
 
 
357 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0411877 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1357  hypothetical protein  26.76 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.124612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  28.33 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3514  hypothetical protein  30.51 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0428  hypothetical protein  36.02 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2042  hypothetical protein  32.83 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.575952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0040  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3014  hypothetical protein  31.58 
 
 
561 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0275  hypothetical protein  28.49 
 
 
385 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28410  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  31.54 
 
 
416 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  23.9 
 
 
244 aa  47.8  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  29.28 
 
 
274 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3736  hypothetical protein  22.06 
 
 
370 aa  47  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 
267 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  29.46 
 
 
273 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  33.61 
 
 
274 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  32.34 
 
 
305 aa  43.9  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  26.77 
 
 
270 aa  43.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 
366 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  28 
 
 
275 aa  43.5  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0417  hypothetical protein  21.15 
 
 
378 aa  43.1  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.716257  normal  0.998447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0691  hypothetical protein  24.49 
 
 
377 aa  42.7  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>