More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0330 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0330  pyruvate kinase  100 
 
 
464 aa  924    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0580  pyruvate kinase  38.13 
 
 
456 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000249893  decreased coverage  0.00109263 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  35.71 
 
 
472 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  35.94 
 
 
578 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  37.53 
 
 
496 aa  280  5e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  36.36 
 
 
476 aa  279  6e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  34.71 
 
 
580 aa  277  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  34.53 
 
 
476 aa  276  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  34.26 
 
 
475 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  37.34 
 
 
596 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  37.27 
 
 
479 aa  273  7e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  36.36 
 
 
484 aa  272  9e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  36.42 
 
 
495 aa  272  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  35.88 
 
 
477 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  34.97 
 
 
477 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  34.26 
 
 
478 aa  270  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  34.26 
 
 
478 aa  270  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  34.32 
 
 
592 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  35.67 
 
 
477 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  34.32 
 
 
592 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  35.5 
 
 
601 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  35.59 
 
 
581 aa  268  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  33.9 
 
 
583 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  35.44 
 
 
478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  34.75 
 
 
477 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  36.48 
 
 
596 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  33.68 
 
 
585 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0063  pyruvate kinase  38 
 
 
449 aa  266  5.999999999999999e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  34.32 
 
 
585 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  35.24 
 
 
590 aa  265  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  36.27 
 
 
596 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  32.99 
 
 
481 aa  264  2e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  33.47 
 
 
477 aa  264  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  34.75 
 
 
477 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  33.26 
 
 
585 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  34.92 
 
 
590 aa  263  4.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  35.44 
 
 
478 aa  263  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  36.06 
 
 
485 aa  263  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  33.4 
 
 
477 aa  262  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  33.47 
 
 
585 aa  262  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  34.18 
 
 
583 aa  262  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  33.47 
 
 
585 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  36.6 
 
 
496 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  36.06 
 
 
597 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  33.06 
 
 
585 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  33.26 
 
 
585 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  33.26 
 
 
585 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  33.26 
 
 
585 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  33.26 
 
 
585 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  33.26 
 
 
585 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  34.23 
 
 
518 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  33.06 
 
 
585 aa  261  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  34.25 
 
 
589 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  35.44 
 
 
478 aa  259  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  35.74 
 
 
470 aa  259  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  35.48 
 
 
594 aa  259  8e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  34.03 
 
 
497 aa  259  9e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  35.5 
 
 
577 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  34.66 
 
 
485 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  35.62 
 
 
473 aa  258  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  33.68 
 
 
467 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05210  Pyruvate kinase (PK)(EC 2.7.1.40) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22360]  33.74 
 
 
526 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  34.97 
 
 
472 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  33.68 
 
 
467 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  34.04 
 
 
478 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  34.74 
 
 
485 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  33.76 
 
 
476 aa  256  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  33.47 
 
 
580 aa  256  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  33.9 
 
 
492 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  34.9 
 
 
477 aa  256  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  33.9 
 
 
492 aa  256  8e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  34.39 
 
 
472 aa  255  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  35.92 
 
 
482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0965  pyruvate kinase  37.29 
 
 
470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0242596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  33.47 
 
 
478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  35.44 
 
 
484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  34.89 
 
 
580 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  34.53 
 
 
584 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  35.08 
 
 
587 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  36.19 
 
 
481 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1106  pyruvate kinase  37.32 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.25736  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0731  pyruvate kinase  38.22 
 
 
469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0570587  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  35.08 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  34.61 
 
 
472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  34.24 
 
 
474 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  33.11 
 
 
470 aa  254  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  37.38 
 
 
484 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001645  pyruvate kinase  35.32 
 
 
470 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000413201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  35.01 
 
 
483 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  37.11 
 
 
484 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  35.26 
 
 
471 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1702  pyruvate kinase  34.39 
 
 
470 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000472586  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1850  pyruvate kinase  34.68 
 
 
474 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117078  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00829  pyruvate kinase  35.11 
 
 
470 aa  253  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  34.61 
 
 
474 aa  253  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  35.22 
 
 
583 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1063  pyruvate kinase  35.18 
 
 
488 aa  252  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.175798  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  34.61 
 
 
494 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  34.19 
 
 
482 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0882  pyruvate kinase  35.48 
 
 
589 aa  251  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.441073  hitchhiker  0.000000000000201084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>