35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3907 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 269 aa  498  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  49.7 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  45.66 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  45.66 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  44.83 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  46.24 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  46.55 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  42.54 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  35.23 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  34.76 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  41.82 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  31.25 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  49.48 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  37.41 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  34.57 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  42.28 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  30.77 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  34.82 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  43.56 
 
 		 242 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  50.79 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1296  Flp pilus assembly protein  44.78 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0121  hypothetical protein  30.63 
 
 		 191 aa  50.4  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  44.62 
 
 		 448 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25290  Flp pilus assembly protein TadB  31.95 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  25.13 
 
 		 325 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  26.16 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  24.58 
 
 		 330 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  25.53 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  25.53 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 322 aa  45.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  38.02 
 
 		 234 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 322 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0620  hypothetical protein  34.13 
 
 		 141 aa  42.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1660  type II secretion system protein  29.44 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>