38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3628 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3628  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 154 aa  298  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3838  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 175 aa  90.5  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000189595  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1135  hypothetical protein  36.26 
 
 		 174 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.22269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12850  hypothetical protein  37.4 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.822848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2204  hypothetical protein  38.36 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000962337  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0317  regulatory protein ArsR  28.47 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8892  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  31.11 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  29.63 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2323  hypothetical protein  32.39 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0166968  normal  0.857189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  31.46 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  31.4 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  33.6 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 333 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 115 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 106 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  34.09 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  32.05 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0502  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 		 114 aa  41.2  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 120 aa  41.2  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  31.15 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  25.4 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  30.99 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 110 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 87 aa  40.4  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  22.83 
 
 		 94 aa  40.4  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>