61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3314 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3314  chorismate mutase  100 
 
 		 199 aa  384  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11913  chorismate mutase  33.64 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2781  chorismate mutase  30.27 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2737  chorismate mutase  30.27 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2391  chorismate mutase  34.81 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0867  chorismate mutase  32.91 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00756442  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0879  chorismate mutase  33.54 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0678  chorismate mutase  30.63 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0967  chorismate mutase  32.91 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000119037  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0529  chorismate mutase  32.91 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0728632  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1007  chorismate mutase  32.91 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000012767  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7813  chorismate mutase  30.63 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0422  chorismate mutase  33.1 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4115  chorismate mutase  32.28 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000003876  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3039  chorismate mutase  31.65 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000151521  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2939  chorismate mutase  31.65 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000062955  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0141  chorismate mutase  31.65 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3005  chorismate mutase  31.65 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148314  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1006  chorismate mutase  31.65 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2635  chorismate mutase  31.65 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0480  chorismate mutase  31.65 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.769814  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03115  chorismate mutase  32.52 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3783  chorismate mutase  30.92 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4860  chorismate mutase  30.92 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.89966 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0483  chorismate mutase  32.12 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1596  chorismate mutase  30.38 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000122178  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5910  chorismate mutase  33 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0915  chorismate mutase  29.11 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2074  chorismate mutase  29.32 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5080  chorismate mutase  31.06 
 
 		 175 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3076  chorismate mutase  29.81 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.359714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2767  chorismate mutase  27.34 
 
 		 139 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209555  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1673  chorismate mutase  28.36 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3495  chorismate mutase  32.04 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.03 
 
 		 393 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1570  chorismate mutase  27.89 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0840576  hitchhiker  0.0000751534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3544  chorismate mutase  29.52 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_003296  RS04710  chorismate mutase  32.38 
 
 		 155 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1464  chorismate mutase  31.14 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.25 
 
 		 386 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.84 
 
 		 393 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3093  chorismate mutase  37.5 
 
 		 664 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0115511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1367  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36 
 
 		 671 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1297  chorismate mutase  37.5 
 
 		 664 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36 
 
 		 667 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2910  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36 
 
 		 667 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1220  chorismate mutase  37.5 
 
 		 664 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950276  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1177  chorismate mutase  36 
 
 		 659 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1264  chorismate mutase  37.5 
 
 		 664 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.728983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1059  chorismate mutase  37.5 
 
 		 657 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.850871  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5099  chorismate mutase  35.96 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.71 
 
 		 396 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36 
 
 		 667 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  34.15 
 
 		 648 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.88 
 
 		 386 aa  43.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0898  prephenate dehydratase / chorismate mutase / phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  37.33 
 
 		 659 aa  42.4  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  29.41 
 
 		 391 aa  42  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.88 
 
 		 391 aa  41.6  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2747  chorismate mutase  32.91 
 
 		 662 aa  41.2  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4818  chorismate mutase  29.94 
 
 		 185 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1072  chorismate mutase  36.84 
 
 		 654 aa  41.2  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>