57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2990 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2990  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
229 aa  457  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2053  FR47 domain protein  58.18 
 
 
240 aa  224  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3797  FR47 domain protein  50.47 
 
 
244 aa  191  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1546  GCN5-related N-acetyltransferase  51.38 
 
 
266 aa  181  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138992  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5486  FR47 domain-containing protein  47.69 
 
 
242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359302  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  46.19 
 
 
213 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3786  FR47 domain protein  46.92 
 
 
224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00741152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  47.64 
 
 
241 aa  161  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  42.34 
 
 
231 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4007  GCN5-related N-acetyltransferase  47.53 
 
 
227 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0945133  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30200  predicted acyltransferase  40.09 
 
 
224 aa  131  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.641139  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1609  FR47 domain-containing protein  37.17 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1632  GCN5-related N-acetyltransferase  38.05 
 
 
247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1737  GCN5-related N-acetyltransferase  40.72 
 
 
227 aa  115  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00558644  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5553  GCN5-related N-acetyltransferase  33.8 
 
 
232 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  39.9 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6749  GCN5-related N-acetyltransferase  43.55 
 
 
242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1672  GCN5-related N-acetyltransferase  39.57 
 
 
238 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537027  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3737  GCN5-related N-acetyltransferase  50.41 
 
 
228 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6287  GCN5-related N-acetyltransferase  48.39 
 
 
239 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4874  GCN5-related N-acetyltransferase  44.37 
 
 
238 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.508212  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1699  FR47 domain-containing protein  38.26 
 
 
238 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1220  FR47-like  38.26 
 
 
238 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0679  putative acetyltransferase  37.44 
 
 
237 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1951  GCN5-related N-acetyltransferase  31.98 
 
 
227 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0547  GCN5-related N-acetyltransferase  46.88 
 
 
228 aa  99  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2433  GCN5-related N-acetyltransferase  31.02 
 
 
228 aa  98.6  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000357302  normal  0.518227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  32.46 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115706  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.88 
 
 
152 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3838  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
269 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113052 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1078  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1948  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
285 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  42.03 
 
 
268 aa  45.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  39.51 
 
 
146 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  34.41 
 
 
399 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
414 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
400 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1619  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1069  acetyltransferase  28.46 
 
 
149 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
394 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.212134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0192  acetyltransferase  27.87 
 
 
147 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
414 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
414 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1857  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 
345 aa  42.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.873376 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0626  acetyltransferase  37.7 
 
 
185 aa  43.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.551251  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1650  GCN5-related N-acetyltransferase  38 
 
 
160 aa  42.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000764715  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2568  GCN5-related N-acetyltransferase  31.63 
 
 
289 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372205  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0983  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.41 
 
 
150 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570176  normal  0.0327101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2619  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 
161 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  42.42 
 
 
322 aa  42  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1539  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
147 aa  42  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1475  acetyltransferase  28.4 
 
 
286 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1820  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
148 aa  41.6  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1687  acetyltransferase, GNAT family  28.4 
 
 
283 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2331  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
166 aa  41.6  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194568  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4440  hypothetical protein  29.81 
 
 
256 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00246211  decreased coverage  0.000186457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>