35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0644 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  796    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  40.65 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  35.41 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  38.81 
 
 		 450 aa  170  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  35.58 
 
 		 411 aa  169  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  35.7 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  37.65 
 
 		 432 aa  156  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  37.91 
 
 		 411 aa  153  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3325  hypothetical protein  38.28 
 
 		 402 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0514676  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  37.06 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  40.2 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  37.44 
 
 		 404 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  35.38 
 
 		 382 aa  132  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1197  hypothetical protein  36.48 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.673489  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  36.34 
 
 		 371 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  34.03 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  33.83 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  35.54 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  32.13 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  35.29 
 
 		 538 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  36.28 
 
 		 313 aa  96.7  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06780  hypothetical protein  30.24 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0858  hypothetical protein  32.17 
 
 		 394 aa  87  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07140  predicted membrane protein  34.83 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  26.6 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  25.12 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  27.83 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18000  hypothetical protein  31.08 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.514365  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1720  transport protein  34.15 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2187  hypothetical protein  31.22 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  27.76 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  24.55 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12320  hypothetical protein  35.09 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144184  normal  0.326836 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  37.5 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  25.54 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>