37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0049 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 185 aa  380  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  56.79 
 
 		 190 aa  184  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2273  protein of unknown function DUF218  42.67 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3967  hypothetical protein  37.5 
 
 		 216 aa  91.3  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0764  hypothetical protein  31.52 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0763  hypothetical protein  35.91 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1575  hypothetical protein  32.35 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16750  hypothetical protein  31.25 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0483  hypothetical protein  31.88 
 
 		 259 aa  52  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  30.51 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  30.82 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  24.6 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  29.63 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  22.99 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  33.58 
 
 		 221 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2597  hypothetical protein  23.21 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  26.47 
 
 		 251 aa  45.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  31.01 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  27.13 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  28.74 
 
 		 228 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  23.84 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  33.6 
 
 		 252 aa  44.7  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  28.19 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  30.83 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  28.91 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  29.32 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  29.32 
 
 		 300 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  31.34 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3013  hypothetical protein  31.4 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  27.5 
 
 		 265 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  27.5 
 
 		 265 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  29.85 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  29.55 
 
 		 302 aa  42  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  25.81 
 
 		 196 aa  41.6  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  28.69 
 
 		 218 aa  41.6  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3216  protein of unknown function DUF218  26.97 
 
 		 244 aa  41.2  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101173  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>