74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1288 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1288  hydrolase  100 
 
 
208 aa  417  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1830  hydrolase  78.74 
 
 
208 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.797395  hitchhiker  0.00000000137231 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1016  phosphoserine phosphatase  77.34 
 
 
212 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2080  hydrolase  76.81 
 
 
208 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0798472 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1212  phosphoserine phosphatase-like hydrolase  30.43 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0825  phosphoserine phosphatase-like hydrolase  30.1 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  31.1 
 
 
406 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0827  phosphoserine phosphatase-like hydrolase  25.93 
 
 
224 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  30.27 
 
 
400 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  27.94 
 
 
398 aa  51.6  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  32.14 
 
 
404 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  31.58 
 
 
289 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  32.93 
 
 
408 aa  49.7  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  31.58 
 
 
289 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  32.89 
 
 
281 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  28.4 
 
 
210 aa  48.9  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226172  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  29.38 
 
 
438 aa  48.5  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  31.17 
 
 
429 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1886  phosphoserine phosphatase SerB  29.85 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  31.43 
 
 
404 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  33.96 
 
 
295 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  30.52 
 
 
413 aa  47.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  31.61 
 
 
279 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  28.08 
 
 
276 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1367  3-phosphoserine phosphatase  26.8 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  30.82 
 
 
429 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  28.3 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  29.67 
 
 
405 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  31.03 
 
 
404 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  30.52 
 
 
404 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  31.51 
 
 
415 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0205  HAD superfamily hydrolase  32.31 
 
 
292 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.855458  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  30.71 
 
 
404 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  29.61 
 
 
316 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  29.61 
 
 
316 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  27.6 
 
 
409 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2446  HAD superfamily hydrolase  27.5 
 
 
269 aa  45.1  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  25.98 
 
 
284 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  29.61 
 
 
281 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  33.33 
 
 
291 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  30.52 
 
 
404 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  28.99 
 
 
309 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  28.87 
 
 
410 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  28.95 
 
 
316 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  29.19 
 
 
405 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  29.14 
 
 
279 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  32.19 
 
 
411 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  28.95 
 
 
281 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  30 
 
 
418 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  28.93 
 
 
299 aa  43.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  29.19 
 
 
330 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  42 
 
 
275 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1580  Cof-like hydrolase  41.54 
 
 
263 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  28.93 
 
 
299 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  28.95 
 
 
281 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  26.02 
 
 
291 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0153  3-deoxy-D-manno-octulosonate 8-phosphate phosphatase  38.96 
 
 
181 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  27.65 
 
 
412 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  30 
 
 
418 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  30 
 
 
278 aa  42.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  27.44 
 
 
302 aa  42.4  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3424  Cof-like hydrolase  37.5 
 
 
271 aa  42.4  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.925804  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  31.58 
 
 
279 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  28.57 
 
 
299 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  25.94 
 
 
410 aa  42  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  29.01 
 
 
330 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1582  phosphoserine phosphatase SerB  25.53 
 
 
208 aa  42  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  32.48 
 
 
291 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0070  phosphoserine phosphatase SerB  29.79 
 
 
216 aa  42  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40365  phosphoserine phosphatase activity  28.57 
 
 
306 aa  41.6  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.288179  normal  0.883376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  29.01 
 
 
330 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3317  Cof-like hydrolase  33.78 
 
 
256 aa  41.6  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000026375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  26.83 
 
 
432 aa  41.2  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0935  phosphoserine phosphatase  27.27 
 
 
224 aa  41.2  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>