49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3957 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3957  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
67 aa  135  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.59115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
814 aa  50.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
839 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  36.36 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  38.1 
 
 
1196 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  36.51 
 
 
751 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
890 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
976 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  37.31 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
891 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  47.5 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
1182 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  33.33 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  34.85 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  35.38 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  31.25 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  31.34 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  30.3 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  35.29 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  28.12 
 
 
71 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  34.38 
 
 
817 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  34.85 
 
 
67 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  28.12 
 
 
69 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  32.81 
 
 
68 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 
730 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  36.92 
 
 
1040 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  26.56 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 
827 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  31.82 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  31.25 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  29.85 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
827 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  32.81 
 
 
834 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  32.81 
 
 
834 aa  40  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  32.81 
 
 
834 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  32.81 
 
 
834 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  32.81 
 
 
834 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  32.81 
 
 
834 aa  40  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  32.81 
 
 
834 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  32.31 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
834 aa  40  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00435  copper transporter  32.81 
 
 
834 aa  40  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03624  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  34.85 
 
 
1182 aa  40  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.102947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  26.56 
 
 
71 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2277  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
59 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.938593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>