More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0784 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0123  CTP synthetase  72.61 
 
 		 524 aa  802    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000806714  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0197  CTP synthetase  74.04 
 
 		 525 aa  816    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000237577  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0125  CTP synthetase  72.61 
 
 		 524 aa  802    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107739  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1012  CTP synthetase  66.54 
 
 		 527 aa  716    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0111787  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0784  CTP synthetase  100 
 
 		 525 aa  1069    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  51.86 
 
 		 534 aa  530  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  50 
 
 		 542 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  50.65 
 
 		 541 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  48.88 
 
 		 535 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  48.88 
 
 		 535 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  50.75 
 
 		 531 aa  508  1e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  50.56 
 
 		 535 aa  510  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  48.88 
 
 		 539 aa  508  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  48.69 
 
 		 533 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  48.5 
 
 		 533 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  48.31 
 
 		 531 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  49.16 
 
 		 536 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  48.03 
 
 		 531 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  50.09 
 
 		 533 aa  504  1e-141  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  50.09 
 
 		 533 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  48.06 
 
 		 563 aa  499  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  49.35 
 
 		 542 aa  497  1e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  48.5 
 
 		 534 aa  495  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  48.5 
 
 		 530 aa  495  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  48.6 
 
 		 535 aa  498  1e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  48.51 
 
 		 555 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  48.5 
 
 		 537 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  47.57 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  47.57 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  47.57 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  47.39 
 
 		 535 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  47.39 
 
 		 535 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  47.39 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  47 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  47.57 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  46.74 
 
 		 536 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  49.35 
 
 		 533 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  47.66 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  47.77 
 
 		 559 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1754  CTP synthetase  48.71 
 
 		 546 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  46.9 
 
 		 536 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  48.11 
 
 		 545 aa  492  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  46.82 
 
 		 535 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0134  CTP synthetase  48.63 
 
 		 541 aa  488  1e-137  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  47.69 
 
 		 542 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  47.08 
 
 		 552 aa  488  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  48.52 
 
 		 545 aa  489  1e-137  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  47.86 
 
 		 534 aa  489  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  47.69 
 
 		 542 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  47.65 
 
 		 549 aa  491  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  47.12 
 
 		 537 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  46.75 
 
 		 542 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  46.37 
 
 		 533 aa  488  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  49.43 
 
 		 534 aa  491  1e-137  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  46.9 
 
 		 536 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  47.48 
 
 		 534 aa  491  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  46.75 
 
 		 542 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  47.32 
 
 		 542 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  47.5 
 
 		 543 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  47.01 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  48.8 
 
 		 535 aa  485  1e-136  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  47.58 
 
 		 536 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  47.57 
 
 		 535 aa  487  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  47.57 
 
 		 538 aa  488  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  47.5 
 
 		 543 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  47.13 
 
 		 542 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1199  CTP synthetase  47.5 
 
 		 581 aa  487  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129574  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3387  CTP synthetase  47.53 
 
 		 545 aa  487  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0942417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  47.65 
 
 		 545 aa  488  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  47.5 
 
 		 543 aa  487  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  47.65 
 
 		 549 aa  485  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  49.43 
 
 		 536 aa  487  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  46.82 
 
 		 546 aa  486  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  47.57 
 
 		 532 aa  488  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2648  CTP synthetase  48.18 
 
 		 555 aa  485  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  48.22 
 
 		 550 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  48.04 
 
 		 547 aa  485  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  47.47 
 
 		 542 aa  486  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0799  CTP synthetase  49.17 
 
 		 530 aa  486  1e-136  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000239863 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  47.38 
 
 		 558 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0029  CTP synthetase  48.34 
 
 		 543 aa  482  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  46.33 
 
 		 547 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0027  CTP synthetase  48.34 
 
 		 543 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  47.12 
 
 		 543 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  47.12 
 
 		 543 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0054  CTP synthetase  48.34 
 
 		 543 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  46.33 
 
 		 547 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  48.69 
 
 		 554 aa  483  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  46.17 
 
 		 552 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  47.31 
 
 		 540 aa  485  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  47.01 
 
 		 536 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3546  CTP synthetase  47.35 
 
 		 545 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.319246  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3443  CTP synthetase  46.35 
 
 		 559 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  47.01 
 
 		 536 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1327  CTP synthetase  45.99 
 
 		 559 aa  481  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0851  CTP synthetase  46.59 
 
 		 545 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.718725  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  47.06 
 
 		 546 aa  480  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0878  CTP synthetase  47.93 
 
 		 528 aa  480  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3181  CTP synthetase  47.53 
 
 		 563 aa  481  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  46.86 
 
 		 542 aa  481  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>