More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0237 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0237  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  51.36 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  48.84 
 
 
261 aa  230  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  49.81 
 
 
260 aa  230  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  43.7 
 
 
275 aa  203  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  40.55 
 
 
262 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  42.61 
 
 
284 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  40 
 
 
301 aa  158  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 
293 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  37.67 
 
 
281 aa  155  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  41.2 
 
 
298 aa  155  8e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  36.03 
 
 
297 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  39.41 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  41.91 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  36.94 
 
 
290 aa  149  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  37.61 
 
 
290 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  36.8 
 
 
292 aa  148  9e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  41.1 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  36.9 
 
 
280 aa  146  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
291 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  36.04 
 
 
276 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  37.32 
 
 
276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  39.42 
 
 
290 aa  144  9e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  35.77 
 
 
293 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  34.55 
 
 
284 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  40.35 
 
 
275 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  38.98 
 
 
294 aa  143  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  36.65 
 
 
288 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  34.62 
 
 
302 aa  142  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  37.07 
 
 
285 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  37.07 
 
 
285 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  37.01 
 
 
269 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0706  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 
281 aa  141  9e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.486021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
292 aa  141  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  35.9 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  38.29 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  37.96 
 
 
292 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  39.48 
 
 
299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  36.33 
 
 
291 aa  138  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  37.8 
 
 
261 aa  138  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  35.9 
 
 
296 aa  138  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  35.14 
 
 
276 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  40 
 
 
285 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  36.58 
 
 
271 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0513  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  35.86 
 
 
273 aa  136  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  37.01 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  35.63 
 
 
275 aa  135  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  34.85 
 
 
266 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0603  dimethyladenosine transferase  36.12 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  34.85 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  35 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  34.6 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  34.85 
 
 
267 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  34.62 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 
263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  37.65 
 
 
243 aa  132  6e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  34.93 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  34.93 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3029  dimethyladenosine transferase  36.73 
 
 
256 aa  129  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  32.12 
 
 
295 aa  130  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  33.09 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  44.04 
 
 
271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6704  predicted protein  36.5 
 
 
268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.477896  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  37.39 
 
 
276 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1053  ribosomal RNA adenine methylase transferase  38.27 
 
 
252 aa  128  9.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000092435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  34.11 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  34.65 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  34.75 
 
 
285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42375  predicted protein  41.2 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320832  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  32.58 
 
 
269 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  33.46 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0791  dimethyladenosine transferase  35.55 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000779511  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2059  dimethyladenosine transferase  34.66 
 
 
280 aa  125  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.740461  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  31.6 
 
 
459 aa  124  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  32.59 
 
 
288 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0501  dimethyladenosine transferase  34.51 
 
 
270 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000511271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  32.48 
 
 
297 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  32.28 
 
 
297 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  32.81 
 
 
258 aa  123  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  35.58 
 
 
297 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  32.28 
 
 
297 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1981  dimethyladenosine transferase  37.75 
 
 
257 aa  123  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  33.99 
 
 
268 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  34.15 
 
 
291 aa  122  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  34.82 
 
 
265 aa  123  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf007  dimethyladenosine transferase  37.01 
 
 
258 aa  122  5e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  31.99 
 
 
291 aa  122  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>