More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0340 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  83.7 
 
 		 953 aa  1709    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  71.16 
 
 		 978 aa  1441    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  69.76 
 
 		 974 aa  1426    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  54.5 
 
 		 958 aa  1050    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  71.16 
 
 		 978 aa  1442    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  69.99 
 
 		 978 aa  1433    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  54.58 
 
 		 968 aa  1036    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  50 
 
 		 932 aa  912    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  70.39 
 
 		 974 aa  1435    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  54.32 
 
 		 974 aa  1050    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  65.63 
 
 		 961 aa  1328    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  51.08 
 
 		 935 aa  946    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  71.14 
 
 		 978 aa  1439    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  69.98 
 
 		 978 aa  1433    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  71.05 
 
 		 973 aa  1436    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  63.89 
 
 		 979 aa  1291    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  54.85 
 
 		 973 aa  1021    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  66.8 
 
 		 981 aa  1339    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  71.16 
 
 		 973 aa  1438    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  66.46 
 
 		 981 aa  1333    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  71.08 
 
 		 973 aa  1442    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  71.16 
 
 		 973 aa  1440    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  71.16 
 
 		 973 aa  1438    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  50.43 
 
 		 928 aa  905    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  47.91 
 
 		 923 aa  841    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  100 
 
 		 969 aa  2026    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0814  anaerobic dehydrogenase  26.83 
 
 		 1434 aa  275  3e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0197792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  30.05 
 
 		 833 aa  231  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  29.36 
 
 		 817 aa  206  2e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  25.24 
 
 		 858 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  27.56 
 
 		 837 aa  198  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  28.35 
 
 		 812 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  26.78 
 
 		 781 aa  191  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  25.34 
 
 		 911 aa  188  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.19 
 
 		 864 aa  185  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  26.84 
 
 		 930 aa  184  9.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  26.27 
 
 		 927 aa  181  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  23.65 
 
 		 934 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  26.97 
 
 		 928 aa  180  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  28.29 
 
 		 856 aa  179  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  25.96 
 
 		 909 aa  179  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0612  conserved hypothetical protein  31.09 
 
 		 1426 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  26.5 
 
 		 932 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  23.11 
 
 		 1155 aa  171  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  22.23 
 
 		 992 aa  170  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  25.89 
 
 		 826 aa  169  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  23.6 
 
 		 839 aa  167  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  26.27 
 
 		 807 aa  167  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  26.33 
 
 		 947 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  25.71 
 
 		 803 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  28.12 
 
 		 805 aa  162  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  23.57 
 
 		 917 aa  162  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  25.28 
 
 		 765 aa  162  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  28.15 
 
 		 805 aa  162  4e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  26.89 
 
 		 759 aa  160  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.84 
 
 		 836 aa  160  9e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1418  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.11 
 
 		 814 aa  160  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  22.55 
 
 		 803 aa  158  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  25.12 
 
 		 938 aa  157  7e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.19 
 
 		 814 aa  157  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.19 
 
 		 814 aa  157  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.19 
 
 		 814 aa  157  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  35.66 
 
 		 722 aa  156  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.08 
 
 		 814 aa  155  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  23.78 
 
 		 1031 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  28.48 
 
 		 910 aa  154  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.408169 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  25.08 
 
 		 814 aa  154  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.08 
 
 		 814 aa  154  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.08 
 
 		 814 aa  154  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.08 
 
 		 814 aa  154  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  25.08 
 
 		 814 aa  154  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.08 
 
 		 814 aa  154  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.08 
 
 		 814 aa  154  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  22.74 
 
 		 855 aa  153  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.05 
 
 		 1020 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.08 
 
 		 814 aa  153  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  25.36 
 
 		 800 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.78 
 
 		 826 aa  153  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.05 
 
 		 1020 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  23.32 
 
 		 843 aa  152  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.97 
 
 		 814 aa  152  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.2 
 
 		 942 aa  152  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  25.04 
 
 		 1148 aa  149  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  22.81 
 
 		 820 aa  148  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1181  molybdopterin oxidoreductase  25.44 
 
 		 1073 aa  148  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  23.58 
 
 		 1029 aa  146  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1668  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.62 
 
 		 811 aa  147  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  25 
 
 		 1038 aa  146  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0610  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.08 
 
 		 804 aa  146  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.124465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  24.03 
 
 		 761 aa  145  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1841  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.73 
 
 		 811 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  22.55 
 
 		 856 aa  145  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0199  molybdopterin oxidoreductase  24.3 
 
 		 917 aa  145  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1674  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.92 
 
 		 811 aa  145  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.666152  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  22.9 
 
 		 1022 aa  144  5e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  31.36 
 
 		 800 aa  144  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0325829 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1609  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.92 
 
 		 811 aa  144  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0422  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.66 
 
 		 806 aa  144  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0580651  decreased coverage  0.000000000595111 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  24.67 
 
 		 821 aa  144  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  28.72 
 
 		 784 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>