More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1775 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  100 
 
 
361 aa  709    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2247  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.73 
 
 
364 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.84 
 
 
368 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.77 
 
 
359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8254  zinc-type alcohol dehydrogenase AdhD (aldehyde reductase)  42.73 
 
 
361 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2878  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  44.22 
 
 
361 aa  262  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3472  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  40.06 
 
 
366 aa  260  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3723  alcohol dehydrogenase  41.38 
 
 
380 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2600  alcohol dehydrogenase  46.87 
 
 
363 aa  256  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163819  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3767  alcohol dehydrogenase  41.32 
 
 
361 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3295  alcohol dehydrogenase  43.01 
 
 
374 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3767  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  40.77 
 
 
361 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836579  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1403  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  42.66 
 
 
361 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304986  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03740  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  41.44 
 
 
363 aa  249  7e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  41.37 
 
 
366 aa  249  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2902  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  41.13 
 
 
361 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2454  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  42.49 
 
 
361 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000626099  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.54 
 
 
375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.38 
 
 
361 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10580  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  41.29 
 
 
364 aa  243  5e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107313  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3391  alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
362 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3380  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
362 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3442  alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
362 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174666  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2766  alcohol dehydrogenase  40.51 
 
 
364 aa  242  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170215  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0408  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  39.89 
 
 
361 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4761  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  41.69 
 
 
362 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3073  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.48 
 
 
363 aa  241  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  39.12 
 
 
362 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2396  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  42.21 
 
 
361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5066  alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 
366 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0364575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  42.5 
 
 
375 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3972  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.59 
 
 
372 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.98607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1341  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  40.75 
 
 
361 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.600384  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  42.42 
 
 
359 aa  237  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4588  alcohol dehydrogenase  38.21 
 
 
368 aa  235  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0092  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 
363 aa  235  8e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3651  alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  36.97 
 
 
379 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2799  alcohol dehydrogenase  46.36 
 
 
363 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.97 
 
 
379 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.97 
 
 
379 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12287  zinc-type alcohol dehydrogenase adhE2  38.27 
 
 
361 aa  233  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1329  alcohol dehydrogenase class 3  43.21 
 
 
361 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2885  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  41.64 
 
 
363 aa  232  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.897584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4227  alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
376 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0910  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.65 
 
 
372 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.788021  normal  0.0507788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  39.17 
 
 
361 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.39 
 
 
372 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.34 
 
 
375 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.53 
 
 
373 aa  230  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.31 
 
 
376 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
376 aa  229  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2272  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.66 
 
 
374 aa  229  7e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0161  zinc-binding dehydrogenase  36.31 
 
 
376 aa  229  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4165  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  39.94 
 
 
361 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356272  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
374 aa  229  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.63 
 
 
373 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  35.41 
 
 
376 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0995  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.88 
 
 
362 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0675195  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.7 
 
 
373 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
375 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3587  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
369 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2527  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
369 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0605767  normal  0.410127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0375  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
376 aa  227  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5633  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
369 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2956  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.14 
 
 
369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00985195  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.56 
 
 
384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
373 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.96 
 
 
372 aa  226  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18780  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  39.26 
 
 
362 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
379 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
379 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
379 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
379 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.86 
 
 
379 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
379 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
379 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  35.41 
 
 
379 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4034  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
369 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3427  alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
376 aa  223  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  36.36 
 
 
370 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  35.14 
 
 
379 aa  222  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0741  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.39 
 
 
370 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2925  alcohol dehydrogenase  41.09 
 
 
361 aa  222  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
370 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0269  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.23 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2747  alcohol dehydrogenase  43.54 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0108  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 
385 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  40.33 
 
 
360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.12 
 
 
369 aa  220  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  35.41 
 
 
376 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4833  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.56 
 
 
368 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
376 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38750  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.5 
 
 
371 aa  218  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3028  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
370 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  34.59 
 
 
377 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  35.42 
 
 
382 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>