More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1688 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1688  aldehyde dehydrogenase family protein  100 
 
 
506 aa  1007    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38450  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  48.8 
 
 
486 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3789  aldehyde dehydrogenase  42.6 
 
 
515 aa  343  5e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  36.29 
 
 
486 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1610  aldehyde dehydrogenase  35.63 
 
 
486 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156903  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1637  aldehyde dehydrogenase  35.63 
 
 
486 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5624  aldehyde dehydrogenase  35.63 
 
 
486 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1663  aldehyde dehydrogenase  35.63 
 
 
486 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  36.09 
 
 
486 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  36.09 
 
 
486 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  36.09 
 
 
486 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0438  aldehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
467 aa  249  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4457  Aldehyde Dehydrogenase  35.29 
 
 
468 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399001  normal  0.0106481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  35.63 
 
 
535 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5886  Aldehyde Dehydrogenase  36.25 
 
 
481 aa  244  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1155  aldehyde dehydrogenase family protein  35.86 
 
 
468 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0704  betaine-aldehyde dehydrogenase  34.75 
 
 
469 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0298725  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  33.54 
 
 
467 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  34.01 
 
 
471 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4370  aldehyde dehydrogenase  34.76 
 
 
467 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7686  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  32.79 
 
 
475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3845  putative aldehyde dehydrogenase family protein  39.65 
 
 
470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5135  aldehyde dehydrogenase  32.66 
 
 
467 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.450877  normal  0.542224 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1710  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.4 
 
 
467 aa  233  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  31.76 
 
 
469 aa  233  8.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  31.61 
 
 
463 aa  231  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  31.3 
 
 
479 aa  230  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  31.82 
 
 
476 aa  230  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1024  aldehyde dehydrogenase  39 
 
 
471 aa  230  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736803  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0153  betaine-aldehyde dehydrogenase  31.22 
 
 
470 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3297  aldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
468 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3589  aldehyde dehydrogenase  39.2 
 
 
475 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.927653  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  34.15 
 
 
504 aa  226  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1749  lactaldehyde dehydrogenase  33.53 
 
 
481 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.451931  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3432  Aldehyde Dehydrogenase  32.51 
 
 
474 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1723  aldehyde dehydrogenase  41.24 
 
 
459 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0635196  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  33.79 
 
 
498 aa  223  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03205  aldehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02830)  31.08 
 
 
473 aa  220  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.31244  normal  0.0342555 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1425  aldehyde dehydrogenase  32.18 
 
 
484 aa  220  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  34.86 
 
 
461 aa  220  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  34.29 
 
 
473 aa  219  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3511  aldehyde dehydrogenase  36.21 
 
 
469 aa  218  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1054  Aldehyde Dehydrogenase  33.2 
 
 
513 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.36 
 
 
468 aa  217  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1459  aldehyde dehydrogenase  33.6 
 
 
472 aa  216  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0779486  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  32.74 
 
 
472 aa  216  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03573  conserved hypothetical protein  30.39 
 
 
446 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0358938  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  31.53 
 
 
500 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  31.53 
 
 
500 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1201  phenylacetaldehyde dehydrogenase  32.36 
 
 
500 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1274  phenylacetaldehyde dehydrogenase  32.3 
 
 
500 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0348  phenylacetaldehyde dehydrogenase  32.36 
 
 
500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1365  phenylacetaldehyde dehydrogenase  32.36 
 
 
500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0943  phenylacetaldehyde dehydrogenase  32.36 
 
 
500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0371587  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0628  phenylacetaldehyde dehydrogenase  32.36 
 
 
500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.596423  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  31.05 
 
 
500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  31.05 
 
 
500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  31.05 
 
 
500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2466  phenylacetaldehyde dehydrogenase  32.36 
 
 
500 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3186  aldehyde dehydrogenase  29.6 
 
 
452 aa  213  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1257  Aldehyde Dehydrogenase  32.99 
 
 
478 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  0.0130742 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  31.05 
 
 
500 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  33.27 
 
 
492 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1692  aldehyde dehydrogenase  35.99 
 
 
467 aa  210  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1537  phenylacetaldehyde dehydrogenase  31.98 
 
 
573 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2503  aldehyde dehydrogenase  33.4 
 
 
477 aa  207  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09198  conserved hypothetical protein  30.39 
 
 
503 aa  206  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  31.42 
 
 
496 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  31.52 
 
 
474 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1049  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  31.6 
 
 
495 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  32.85 
 
 
476 aa  206  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2005  aldehyde dehydrogenase  32.65 
 
 
516 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.823554 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  30.88 
 
 
476 aa  204  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  30.8 
 
 
476 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  33.07 
 
 
510 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  30.87 
 
 
489 aa  204  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0904  aldehyde dehydrogenase  33.4 
 
 
481 aa  203  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  31.56 
 
 
490 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0646  succinate semialdehyde dehydrogenase  32.73 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.868265  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  34.9 
 
 
496 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2710  Aldehyde Dehydrogenase  35.24 
 
 
467 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3304  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  30.47 
 
 
477 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.154933 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3616  Aldehyde Dehydrogenase  36.05 
 
 
469 aa  201  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4074  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  33.33 
 
 
499 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2124  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  32.85 
 
 
474 aa  199  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.775218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  30.63 
 
 
497 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  32.15 
 
 
487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  30.21 
 
 
497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  30.42 
 
 
497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0539  aldehyde dehydrogenase A  29.53 
 
 
479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  34.12 
 
 
494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  33.96 
 
 
493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  31.92 
 
 
481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  33.82 
 
 
494 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  33.82 
 
 
494 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  35.17 
 
 
473 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0985  phenylacetaldehyde dehydrogenase  30.65 
 
 
499 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1445  aldehyde dehydrogenase A  30.69 
 
 
479 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.53 
 
 
494 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3642  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  31.2 
 
 
474 aa  197  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>