More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1385 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1385  putative oxidoreductase  100 
 
 
327 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1436  aldo/keto reductase  61.09 
 
 
325 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105147  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3284  aldo/keto reductase  57.37 
 
 
319 aa  332  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  normal  0.242197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7948  aldo/keto reductase  53.57 
 
 
316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2761  aldo/keto reductase  60.28 
 
 
303 aa  305  7e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3315  aldo/keto reductase  50.48 
 
 
315 aa  278  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5366  aldo/keto reductase  52.44 
 
 
317 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3013  aldo/keto reductase  47.46 
 
 
330 aa  260  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5354  aldo/keto reductase  46.67 
 
 
330 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.6083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0045  aldo/keto reductase  43.37 
 
 
322 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0318  aldo/keto reductase  39.75 
 
 
320 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.62816  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03274  oxidoreductase  37.39 
 
 
323 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0480  aldo/keto reductase  39.13 
 
 
321 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1330  aldo/keto reductase  31.46 
 
 
300 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2700  aldo/keto reductase  36.65 
 
 
321 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000432356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  36.36 
 
 
315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0485  aldo/keto reductase  38.32 
 
 
321 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5334  aldo/keto reductase  37.08 
 
 
324 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  35.36 
 
 
338 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1488  aldo/keto reductase  35.03 
 
 
337 aa  162  9e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  36.62 
 
 
342 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2848  aldo/keto reductase  35.05 
 
 
311 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0082562  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2301  aldo/keto reductase  35.51 
 
 
332 aa  159  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  36.09 
 
 
320 aa  159  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0452  aldo/keto reductase  37.69 
 
 
321 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  34.12 
 
 
315 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3551  aldo/keto reductase  35.47 
 
 
317 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5855  aldo/keto reductase  36.17 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2988  aldo/keto reductase  35.44 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000283356 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3073  aldo/keto reductase  34.46 
 
 
325 aa  156  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3891  aldo/keto reductase  33.14 
 
 
318 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1182  aldo/keto reductase  34.45 
 
 
334 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  32.63 
 
 
317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6313  aldo/keto reductase  44.92 
 
 
307 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.68408  normal  0.160779 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2701  aldo/keto reductase  33.62 
 
 
325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.117556  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0885  aldo/keto reductase  34.59 
 
 
341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  35.35 
 
 
314 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  33.53 
 
 
326 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0104  aldo/keto reductase  33.83 
 
 
313 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2573  aldo/keto reductase  33.62 
 
 
337 aa  149  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  34.15 
 
 
325 aa  149  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3831  aldo/keto reductase  33.62 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  32.23 
 
 
314 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4794  aldo/keto reductase  32.77 
 
 
358 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  33.96 
 
 
322 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  35.15 
 
 
312 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1402  aldo/keto reductase  36 
 
 
318 aa  142  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0529164  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.14 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  32.63 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1447  aldo/keto reductase  34.1 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652704  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  31.61 
 
 
358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  31.29 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  32.76 
 
 
325 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.44 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  31.4 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5044  aldo/keto reductase  34.78 
 
 
316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4424  aldo/keto reductase  32.96 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00178858  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.44 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.44 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.44 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.44 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2461  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.66 
 
 
463 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454661  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1550  aldo/keto reductase  32.47 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2964  aldo/keto reductase  32.23 
 
 
321 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1269  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.14 
 
 
331 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594857  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  32.73 
 
 
329 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  33.44 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  32.26 
 
 
335 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2327  aldo/keto reductase  31.5 
 
 
345 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2706  aldo/keto reductase  32.35 
 
 
325 aa  136  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.315446  normal  0.0513811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1189  aldo/keto reductase  31.58 
 
 
349 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.712785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  33.13 
 
 
321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1384  aldo/keto reductase  33.23 
 
 
323 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.475337  normal  0.194601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3141  aldo/keto reductase  32.73 
 
 
315 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0627738  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1320  putative oxidoreductase  33.23 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  32.16 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2556  aldo/keto reductase  31.43 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5129  aldo/keto reductase  32.37 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5730  aldo/keto reductase  32.37 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4493  aldo/keto reductase  32.37 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14990  putative oxidoreductase  33.04 
 
 
316 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.239005 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5005  aldo/keto reductase  32.35 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3082  aldo/keto reductase  31.93 
 
 
343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0228208  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3146  aldo/keto reductase  32.08 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2362  aldo/keto reductase  32.94 
 
 
324 aa  132  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  30.54 
 
 
315 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1125  aldo/keto reductase  32 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  33.44 
 
 
317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3492  aldo/keto reductase  31.16 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3496  aldo/keto reductase  30.29 
 
 
346 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.496722  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  31.42 
 
 
333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3686  aldo/keto reductase  30.29 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0158243 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3379  aldo/keto reductase  29.43 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0900  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.43 
 
 
346 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  32.56 
 
 
353 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1164  aldo/keto reductase  33.05 
 
 
323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.123786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  34.96 
 
 
325 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7438  aldo/keto reductase  35.19 
 
 
360 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.798482 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0747  aldo/keto reductase  29.14 
 
 
346 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.636269  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2875  aldo/keto reductase  33.53 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.536931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>