51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0236 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  70.64 
 
 		 220 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  59.72 
 
 		 256 aa  255  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  59.26 
 
 		 222 aa  240  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  56.48 
 
 		 222 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  55.94 
 
 		 273 aa  225  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  55.94 
 
 		 273 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  55.94 
 
 		 273 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  53.96 
 
 		 301 aa  222  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  52.97 
 
 		 304 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  56.06 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  47.93 
 
 		 449 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  48.17 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  45.74 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  45.58 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  46.46 
 
 		 225 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  45.96 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  41.98 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  42.2 
 
 		 239 aa  161  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  41.41 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  44.55 
 
 		 327 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  46.15 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  47.4 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  39.07 
 
 		 251 aa  147  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  42.27 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  42.71 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  38.66 
 
 		 532 aa  135  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  40.91 
 
 		 218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  38.14 
 
 		 453 aa  128  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  40.4 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  35.68 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  36.76 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  37.3 
 
 		 202 aa  99.4  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  34.16 
 
 		 227 aa  91.7  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  29.22 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  33.15 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  32.34 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2237  protein of unknown function DUF124  28.76 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000136487  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35210  hypothetical protein  28.37 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  31.34 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4757  protein of unknown function DUF124  26.15 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1838  protein of unknown function DUF124  30.09 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  32.74 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04170  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  25.14 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2326  hypothetical protein  32.03 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45623  predicted protein  31.09 
 
 		 259 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  36.71 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  28.96 
 
 		 247 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  28.96 
 
 		 247 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>