79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3106 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3106  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1047    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0342  hypothetical protein  40.96 
 
 		 639 aa  347  3e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.894241  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0107  hypothetical protein  24.9 
 
 		 527 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0730  hypothetical protein  29.73 
 
 		 490 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1661  hypothetical protein  29.09 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0301  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.141921  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3891  hypothetical protein  26.76 
 
 		 521 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4095  hypothetical protein  25.95 
 
 		 521 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0421  hypothetical protein  30 
 
 		 488 aa  57  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2611  hypothetical protein  38.46 
 
 		 527 aa  56.6  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1801  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 		 507 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.679087  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  31.48 
 
 		 330 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0724  hypothetical protein  26.67 
 
 		 351 aa  54.3  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2156  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  29.03 
 
 		 284 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  27.87 
 
 		 392 aa  52  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  29.03 
 
 		 411 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  31.45 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.82 
 
 		 374 aa  51.2  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1605  nucleotidyl transferase  41.38 
 
 		 257 aa  50.8  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.473509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  29.03 
 
 		 411 aa  50.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  29.66 
 
 		 331 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1328  hypothetical protein  29.77 
 
 		 526 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0459237  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.78 
 
 		 349 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  30.1 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  25.81 
 
 		 234 aa  48.9  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  28.04 
 
 		 325 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  46.67 
 
 		 345 aa  49.3  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3094  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  26.23 
 
 		 256 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  29.09 
 
 		 331 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  31.53 
 
 		 346 aa  47.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.18 
 
 		 405 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4540  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  32.43 
 
 		 257 aa  47.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0266961  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  28.83 
 
 		 341 aa  47.4  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  29.26 
 
 		 347 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  28.7 
 
 		 247 aa  47.4  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  26.34 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.76 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  41.07 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  27.27 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3113  Nucleotidyl transferase  30.36 
 
 		 231 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.91659  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  29.36 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  26.17 
 
 		 325 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2384  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  26.23 
 
 		 256 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1897  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  35.48 
 
 		 265 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  27.93 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  33.8 
 
 		 247 aa  46.2  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0148  nucleotidyl transferase  32.26 
 
 		 236 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  28.88 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  24.24 
 
 		 249 aa  45.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.81 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1959  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  27.91 
 
 		 258 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0146821  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  27.36 
 
 		 399 aa  45.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.14 
 
 		 562 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0521  nucleotidyl transferase  22.64 
 
 		 242 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0877  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  36.51 
 
 		 254 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0970  Nucleotidyl transferase  25 
 
 		 244 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3175  Nucleotidyl transferase  24.07 
 
 		 272 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.89 
 
 		 355 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  25.45 
 
 		 253 aa  44.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  23.36 
 
 		 326 aa  44.7  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1908  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  36.51 
 
 		 260 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  30.83 
 
 		 414 aa  44.3  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  28.3 
 
 		 355 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4970  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  35.48 
 
 		 279 aa  44.3  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  34.43 
 
 		 352 aa  44.3  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  28.85 
 
 		 248 aa  43.9  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  26.67 
 
 		 393 aa  43.9  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0560  nucleotidyl transferase  29.09 
 
 		 351 aa  43.9  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2889  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  35.48 
 
 		 259 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  35.09 
 
 		 387 aa  43.5  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  28.85 
 
 		 245 aa  43.9  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3694  glucose-1-phosphate cytidylyl-transferase  40.91 
 
 		 263 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  28.43 
 
 		 387 aa  43.5  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2782  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  29.33 
 
 		 276 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.600375 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25 
 
 		 331 aa  43.5  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14071  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  33.87 
 
 		 257 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0382  nucleotidyltransferase family protein  27.54 
 
 		 269 aa  43.1  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  31.88 
 
 		 263 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3335  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  29.33 
 
 		 276 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>