55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0448 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  100 
 
 
712 aa  1472    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  38.32 
 
 
821 aa  438  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2776  subtilisin-like serine protease  26.3 
 
 
830 aa  160  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.827378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.96 
 
 
827 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  27.96 
 
 
795 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  25.62 
 
 
847 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2676  hypothetical protein  24.16 
 
 
822 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  25.75 
 
 
847 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  26.39 
 
 
829 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  26.67 
 
 
814 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  27.52 
 
 
835 aa  126  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  26.68 
 
 
850 aa  124  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4804  hypothetical protein  25.08 
 
 
831 aa  123  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1292  hypothetical protein  25.58 
 
 
841 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0886595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2088  hypothetical protein  25.45 
 
 
847 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4253  hypothetical protein  23.9 
 
 
846 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  26.06 
 
 
823 aa  114  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4275  hypothetical protein  24.46 
 
 
826 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4893  hypothetical protein  23.93 
 
 
835 aa  110  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  25.25 
 
 
830 aa  107  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1074  hypothetical protein  24.12 
 
 
825 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3058  hypothetical protein  29.43 
 
 
790 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  25.67 
 
 
789 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  25.67 
 
 
849 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5488  hypothetical protein  25.21 
 
 
847 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0523  hypothetical protein  23.61 
 
 
743 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3670  hypothetical protein  23.99 
 
 
851 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758768  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  25 
 
 
845 aa  97.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  29.46 
 
 
570 aa  90.9  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2107  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.32 
 
 
760 aa  84.3  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817284  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  24.79 
 
 
869 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4413  hypothetical protein  24.68 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4146  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.77 
 
 
729 aa  70.5  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0370543 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3795  hypothetical protein  23.89 
 
 
740 aa  70.5  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.542831  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1489  hypothetical protein  24.6 
 
 
858 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1466  hypothetical protein  24.6 
 
 
858 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.467243  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  29.83 
 
 
872 aa  68.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5900  hypothetical protein  23.25 
 
 
792 aa  68.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3821  hypothetical protein  23.64 
 
 
870 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0310113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4461  hypothetical protein  22.88 
 
 
858 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2443  hypothetical protein  24.63 
 
 
739 aa  64.7  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0748  hypothetical protein  24.68 
 
 
855 aa  63.9  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.298605  normal  0.440798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1970  hypothetical protein  23.08 
 
 
738 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5574  hypothetical protein  26.09 
 
 
844 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218076  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5977  hypothetical protein  26.09 
 
 
844 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3739  hypothetical protein  23.71 
 
 
740 aa  59.7  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00635  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.77 
 
 
742 aa  54.3  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617158  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2658  hypothetical protein  24.56 
 
 
839 aa  54.3  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000653199  hitchhiker  0.00786959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5697  hypothetical protein  22.22 
 
 
737 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0295  hypothetical protein  23.28 
 
 
425 aa  52  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0359768  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0512  hypothetical protein  23.55 
 
 
835 aa  51.2  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0576205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.46 
 
 
1253 aa  51.2  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5592  hypothetical protein  25.09 
 
 
293 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3110  hypothetical protein  25.33 
 
 
611 aa  47.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464764  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1082  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.97 
 
 
743 aa  47.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>