26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0135 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  192  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  59.78 
 
 
378 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  56.84 
 
 
369 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  43.62 
 
 
368 aa  81.3  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  46.75 
 
 
371 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  47.83 
 
 
363 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  39.08 
 
 
377 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  41.76 
 
 
391 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  38.67 
 
 
378 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  34.04 
 
 
464 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  35.63 
 
 
374 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  36.49 
 
 
459 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  50 
 
 
408 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  45.45 
 
 
374 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  31.87 
 
 
465 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  38.03 
 
 
527 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  35.87 
 
 
465 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  35.14 
 
 
478 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  33.78 
 
 
459 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  38.81 
 
 
419 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  31.03 
 
 
378 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  34.78 
 
 
565 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1541  hypothetical protein  39.13 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0141757 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  33.73 
 
 
429 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  32.26 
 
 
466 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  31.11 
 
 
457 aa  40.4  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>