More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0106 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0106  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 454 aa  944    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  36.96 
 
 		 685 aa  93.6  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  39.53 
 
 		 1402 aa  93.2  8e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  35.46 
 
 		 684 aa  92.8  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.07 
 
 		 789 aa  90.9  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 490 aa  89.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  34.01 
 
 		 264 aa  89.7  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  37.23 
 
 		 241 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  40.65 
 
 		 1037 aa  88.6  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 490 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  34.31 
 
 		 1493 aa  86.7  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.21 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.57 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 		 1430 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  34.09 
 
 		 831 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  31.07 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  37.32 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.14 
 
 		 528 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.41 
 
 		 961 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.85 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  32.54 
 
 		 971 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.81 
 
 		 971 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.98 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  34.09 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.95 
 
 		 557 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  30.29 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  34.09 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.81 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  37.21 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  36.09 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  37.3 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 		 1032 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  25.11 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  29.12 
 
 		 636 aa  79.7  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2182  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.52 
 
 		 1060 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.36 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35.97 
 
 		 1002 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  34.04 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  27.81 
 
 		 667 aa  77.8  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  36.28 
 
 		 185 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1877 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.67 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  29.45 
 
 		 525 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  26.18 
 
 		 678 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 		 757 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  41.74 
 
 		 763 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3606  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 		 637 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.299495  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  37.39 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.15 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.31 
 
 		 557 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  30.38 
 
 		 530 aa  76.6  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 		 562 aa  76.6  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.62 
 
 		 627 aa  76.6  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 		 723 aa  76.6  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 303 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  38.66 
 
 		 193 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  30.53 
 
 		 484 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.54 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.77 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  33.33 
 
 		 961 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  28 
 
 		 710 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  26.16 
 
 		 690 aa  74.7  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  34.21 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 976 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  32.62 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 		 642 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  32.68 
 
 		 1141 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  26.46 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  34.11 
 
 		 680 aa  73.9  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.49 
 
 		 687 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  29.48 
 
 		 547 aa  73.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  34.72 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  28.86 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  34.11 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.71 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  27.32 
 
 		 573 aa  73.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6564  serine/threonine protein kinase  30.64 
 
 		 626 aa  73.2  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0993188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  32.85 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 		 632 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.01 
 
 		 863 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.62 
 
 		 346 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  34.09 
 
 		 393 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.07 
 
 		 707 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1908  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.79 
 
 		 655 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182347  hitchhiker  0.00089522 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  27.22 
 
 		 776 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6716  serine/threonine protein kinase  26.49 
 
 		 696 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.75 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  36.52 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  32.6 
 
 		 552 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  27.75 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  28.42 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  24.31 
 
 		 666 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2000  serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 		 597 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  25.53 
 
 		 599 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34.09 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>