More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2176 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2176  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
501 aa  1022    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2249  Aldehyde Dehydrogenase  66.73 
 
 
529 aa  650    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408136  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2925  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  70.16 
 
 
530 aa  665    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.739549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6477  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  84.15 
 
 
511 aa  832    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140482  normal  0.0817062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2872  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  66.99 
 
 
561 aa  608  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.102568  normal  0.763851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2374  aldehyde dehydrogenase  65.33 
 
 
533 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1373  Aldehyde Dehydrogenase  48.53 
 
 
529 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.586199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2080  Aldehyde Dehydrogenase  46.28 
 
 
530 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319656  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  44.51 
 
 
493 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  43.96 
 
 
498 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  43 
 
 
499 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  43.42 
 
 
493 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  42 
 
 
496 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  41.83 
 
 
500 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  44.4 
 
 
516 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  42.22 
 
 
498 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  41.08 
 
 
493 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  39.68 
 
 
503 aa  356  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  40.73 
 
 
497 aa  355  7.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  40.44 
 
 
496 aa  345  8e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  39.18 
 
 
505 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  40 
 
 
496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  40.56 
 
 
498 aa  336  7e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  38.87 
 
 
482 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  37.56 
 
 
478 aa  288  2e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.1 
 
 
480 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  36.46 
 
 
479 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1810  aldehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
507 aa  281  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0895  aldehyde dehydrogenase  37.25 
 
 
496 aa  280  4e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2952  aldehyde dehydrogenase  41.06 
 
 
494 aa  276  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4799  aldehyde dehydrogenase  41.91 
 
 
513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228606  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2725  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 
494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1292  putative aldehyde dehydrogenase  41.29 
 
 
494 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1643  aldehyde dehydrogenase  42.38 
 
 
514 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  38.83 
 
 
482 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3514  aldehyde dehydrogenase  37.63 
 
 
496 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1935  Aldehyde Dehydrogenase  40.86 
 
 
515 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5258  aldehyde dehydrogenase family protein  38.05 
 
 
496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0956812  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5168  aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 
496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.545651  normal  0.0529953 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  36.19 
 
 
478 aa  271  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3681  Aldehyde Dehydrogenase  36.78 
 
 
509 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.160701 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  35.53 
 
 
480 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51050  aldehyde dehydrogenase  38.81 
 
 
529 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.790236  hitchhiker  0.000000280962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  36.36 
 
 
480 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5034  Aldehyde Dehydrogenase  36.83 
 
 
512 aa  269  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.96279  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0213  aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 
496 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02440  probable piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  34.69 
 
 
517 aa  269  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.145685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5310  aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 
496 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.09139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4356  aldehyde dehydrogenase  39.02 
 
 
497 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3627  aldehyde dehydrogenase  37.3 
 
 
503 aa  268  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.225192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1891  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  37.53 
 
 
496 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1305  hypothetical protein  34.32 
 
 
506 aa  267  4e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1304  hypothetical protein  34.69 
 
 
506 aa  267  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3110  aldehyde dehydrogenase  38.36 
 
 
503 aa  266  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2515  aldehyde dehydrogenase  37.89 
 
 
502 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3159  aldehyde dehydrogenase  37.35 
 
 
510 aa  266  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510599  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3050  aldehyde dehydrogenase  39.21 
 
 
505 aa  266  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  35.68 
 
 
484 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  37.08 
 
 
483 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1249  putative aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 
517 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.586964  normal  0.195396 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0851  aldehyde dehydrogenase family protein  38 
 
 
510 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.3 
 
 
483 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0908  aldehyde dehydrogenase family protein  38 
 
 
510 aa  264  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3207  aldehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
507 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04370  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  39.05 
 
 
502 aa  263  4e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0694384  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5719  aldehyde dehydrogenase  37.11 
 
 
511 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0053  NAD+-dependent aldehyde dehydrogenase  36.08 
 
 
513 aa  263  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294744 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2418  Aldehyde Dehydrogenase  34.56 
 
 
509 aa  263  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.354297  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1287  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  40.36 
 
 
529 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.195154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1270  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  40.36 
 
 
529 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  35.06 
 
 
501 aa  262  8.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.08 
 
 
483 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00811  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  36.23 
 
 
526 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2080  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  37.74 
 
 
535 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1201  Aldehyde Dehydrogenase  37.34 
 
 
508 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  35.86 
 
 
483 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0495  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  37.74 
 
 
535 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1983  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  37.74 
 
 
535 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.467397  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0566  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  37.74 
 
 
535 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0745334  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1939  Aldehyde Dehydrogenase  41.52 
 
 
510 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0678  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  37.74 
 
 
535 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.808953  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  36.67 
 
 
483 aa  261  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0779  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  37.74 
 
 
503 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0381383  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1631  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  37.74 
 
 
503 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1710  aldehyde dehydrogenase  37.19 
 
 
513 aa  261  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3504  aldehyde dehydrogenase  39.35 
 
 
522 aa  260  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1459  aldehyde dehydrogenase  36.7 
 
 
510 aa  259  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.63 
 
 
483 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  35.63 
 
 
483 aa  259  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.63 
 
 
483 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02148  putative transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  38.56 
 
 
504 aa  259  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1728  Aldehyde Dehydrogenase  35.25 
 
 
510 aa  259  9e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193131  normal  0.860615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0787  aldehyde dehydrogenase  38.8 
 
 
511 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.802258  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  35.73 
 
 
483 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0898  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  37.16 
 
 
503 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.04 
 
 
483 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0310  Aldehyde Dehydrogenase  38.26 
 
 
512 aa  259  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  38.01 
 
 
482 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0550  aldehyde dehydrogenase  38.14 
 
 
496 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.499544  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.63 
 
 
483 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>