43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1263 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1263  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 152 aa  293  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0359346  normal  0.130188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  67.11 
 
 		 154 aa  201  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3101  RDD domain containing protein  54.61 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0763481  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1595  RDD domain containing protein  43.75 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1601  RDD domain-containing protein  42.31 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16400  hypothetical protein  42.57 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.428616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2111  RDD domain containing protein  45.91 
 
 		 174 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15380  hypothetical protein  44.76 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0933  RDD domain containing protein  44.68 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7409  RDD domain containing protein  41.22 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0926  RDD domain containing protein  41.88 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3290  RDD domain containing protein  46.03 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0924  RDD domain-containing protein  49.12 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1483  RDD domain containing protein  42.52 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3141  RDD  46.46 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2929  RDD domain-containing protein  38 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3330  RDD domain-containing protein  39.42 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.177645 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3381  RDD domain-containing protein  39.42 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0851083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3319  RDD domain-containing protein  39.42 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.436382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2037  RDD domain containing protein  43.61 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.905521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  39.83 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16490  hypothetical protein  37.06 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829051  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12248  hypothetical protein  41.22 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300466  normal  0.915257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3584  RDD domain-containing protein  39.71 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0783215  normal  0.0483583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1916  RDD domain containing protein  39.69 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0253441  hitchhiker  0.000670686 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13390  hypothetical protein  39.2 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.408767  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1511  RDD domain containing protein  38.22 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1771  RDD domain-containing protein  44.83 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3331  RDD domain-containing protein  36.36 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00294231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2296  RDD domain-containing protein  36.92 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07510  hypothetical protein  37.11 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.38358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3079  RDD domain containing protein  33.93 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0151194  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3372  RDD domain containing protein  40.31 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3567  RDD domain-containing protein  40.16 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  30.72 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  35.29 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  34.64 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  30.13 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  31.08 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4895  RDD domain-containing protein  32.2 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  28.1 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  28.1 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  28.1 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>