More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0833 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0833  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
309 aa  588  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.512695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4123  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.48 
 
 
310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0241029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.86 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0764  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.88 
 
 
361 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.22 
 
 
331 aa  237  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.24 
 
 
329 aa  236  4e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4122  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.49 
 
 
311 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0525218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  40.33 
 
 
317 aa  227  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  39.16 
 
 
327 aa  223  3e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40 
 
 
316 aa  222  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4145  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.2 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.67 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.05 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.46 
 
 
314 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.74 
 
 
309 aa  218  8.999999999999998e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.94 
 
 
325 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.53 
 
 
314 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.05 
 
 
312 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.92 
 
 
313 aa  215  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.7 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.09 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1451  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.56 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.212954  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.5 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.42 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.58 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.86 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.18 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.2 
 
 
316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.5 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.54 
 
 
317 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.83 
 
 
331 aa  212  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1558  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.58 
 
 
312 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.47 
 
 
312 aa  211  9e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.74 
 
 
323 aa  211  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.18 
 
 
331 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.07 
 
 
315 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.09 
 
 
309 aa  211  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.06 
 
 
312 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03490  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.2 
 
 
334 aa  210  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.489296  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11861  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.91 
 
 
331 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.37 
 
 
316 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.31 
 
 
330 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.25 
 
 
327 aa  211  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.69 
 
 
317 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.511397 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.26 
 
 
315 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.54 
 
 
314 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.93 
 
 
322 aa  209  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.23 
 
 
337 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.13 
 
 
309 aa  209  6e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.07 
 
 
312 aa  209  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.66 
 
 
311 aa  209  6e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.05 
 
 
316 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  37.54 
 
 
326 aa  209  6e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0673  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.94 
 
 
314 aa  209  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000671501  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.18 
 
 
359 aa  208  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.33 
 
 
314 aa  208  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.96 
 
 
329 aa  208  9e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0670  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.71 
 
 
331 aa  208  9e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00572245  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.93 
 
 
331 aa  208  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15031  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.71 
 
 
331 aa  208  9e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.66 
 
 
309 aa  208  9e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.54 
 
 
322 aa  208  9e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.66 
 
 
309 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.47 
 
 
338 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.81 
 
 
319 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.24 
 
 
331 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.84 
 
 
312 aa  207  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000100275  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.99 
 
 
331 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.319247  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.89 
 
 
309 aa  207  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.67 
 
 
314 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.98 
 
 
313 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.81 
 
 
319 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.06 
 
 
325 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.69 
 
 
311 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.66 
 
 
309 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.26 
 
 
310 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3154  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.85 
 
 
326 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.911142  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.26 
 
 
310 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11871  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.91 
 
 
331 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2931  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.86 
 
 
340 aa  205  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134005  normal  0.0220495 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.89 
 
 
331 aa  205  7e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.19 
 
 
342 aa  205  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0839  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.66 
 
 
317 aa  205  9e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.82 
 
 
330 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.29 
 
 
314 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.16 
 
 
308 aa  204  1e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.34 
 
 
310 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1674  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.09 
 
 
327 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.09 
 
 
323 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.3 
 
 
315 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.29 
 
 
313 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32370  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.11 
 
 
326 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531624  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.24 
 
 
331 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.147095  normal  0.740679 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.35 
 
 
316 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.94 
 
 
338 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.45 
 
 
318 aa  203  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.66 
 
 
321 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.26 
 
 
315 aa  203  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.66 
 
 
321 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.13 
 
 
317 aa  203  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>