19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0729 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0729  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  944    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.952258  normal  0.0282933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1364  hypothetical protein  65.98 
 
 		 462 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3173  hypothetical protein  44.74 
 
 		 497 aa  323  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3547  hypothetical protein  44.22 
 
 		 496 aa  323  6e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.884895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8624  hypothetical protein  43.84 
 
 		 509 aa  294  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0959  hypothetical protein  44.3 
 
 		 471 aa  263  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.658844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4100  hypothetical protein  43.12 
 
 		 532 aa  260  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0975  hypothetical protein  46.12 
 
 		 493 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8783  hypothetical protein  41.05 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1753  hypothetical protein  44.1 
 
 		 562 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179744  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6255  hypothetical protein  41.36 
 
 		 449 aa  227  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3062  hypothetical protein  36.71 
 
 		 589 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.319851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3375  hypothetical protein  36.62 
 
 		 507 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1855  hypothetical protein  35.57 
 
 		 827 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152269  decreased coverage  0.00336297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  31.24 
 
 		 749 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5897  hypothetical protein  33.43 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0016856  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0718  hypothetical protein  36.92 
 
 		 470 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.695785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02510  hypothetical protein  22.41 
 
 		 440 aa  53.5  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  24.89 
 
 		 1033 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>