151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0804 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  827    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  49.08 
 
 		 384 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  49.61 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1758  protein of unknown function DUF482  50.13 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  45.22 
 
 		 390 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  50.13 
 
 		 392 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  49.35 
 
 		 392 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  49.61 
 
 		 392 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1962  protein of unknown function DUF482  48.96 
 
 		 456 aa  351  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  46.28 
 
 		 373 aa  351  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  49.61 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  49.61 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  50.26 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  49.35 
 
 		 392 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1760  hypothetical protein  48.57 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  49.74 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  49.09 
 
 		 441 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  50 
 
 		 374 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  49.09 
 
 		 392 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  49.09 
 
 		 441 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  49.09 
 
 		 441 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  49.09 
 
 		 464 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  49.87 
 
 		 410 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  48.83 
 
 		 392 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  48.83 
 
 		 392 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  45.54 
 
 		 418 aa  342  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  46.75 
 
 		 415 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  47.75 
 
 		 390 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  47.56 
 
 		 408 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  45.95 
 
 		 389 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  48.55 
 
 		 374 aa  333  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  45.95 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  47.58 
 
 		 410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  46.72 
 
 		 438 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  46.91 
 
 		 400 aa  326  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  48.19 
 
 		 410 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4876  hypothetical protein  44.55 
 
 		 407 aa  323  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239884  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  44.56 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1736  hypothetical protein  44.69 
 
 		 414 aa  321  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.327747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0114  hypothetical protein  43.83 
 
 		 421 aa  318  9e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  44.56 
 
 		 388 aa  317  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  45.11 
 
 		 375 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  46.17 
 
 		 374 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  45.23 
 
 		 375 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  44.57 
 
 		 374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  44.96 
 
 		 403 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  45.4 
 
 		 375 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  41.03 
 
 		 405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  44.96 
 
 		 394 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  44.62 
 
 		 398 aa  308  9e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  43.38 
 
 		 397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  47.06 
 
 		 374 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3142  hypothetical protein  46.55 
 
 		 386 aa  305  9.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0531471 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  45.8 
 
 		 374 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  42.49 
 
 		 392 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  45.21 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  44.33 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  44.25 
 
 		 405 aa  302  9e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2308  hypothetical protein  39.64 
 
 		 451 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0870816  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  43.32 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  42.89 
 
 		 406 aa  299  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  39.9 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  40.92 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1930  protein of unknown function DUF482  44.39 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.207995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  42.4 
 
 		 406 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  43.67 
 
 		 390 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  41.94 
 
 		 406 aa  296  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  42.75 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  44.04 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  38.01 
 
 		 455 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  43.15 
 
 		 423 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  44.61 
 
 		 406 aa  293  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_004310  BR1167  hypothetical protein  43.47 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0877771  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1124  hypothetical protein  43.47 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  40.68 
 
 		 411 aa  292  6e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  41.58 
 
 		 405 aa  289  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  42.52 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1772  protein of unknown function DUF482  42.09 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1121  hypothetical protein  42.39 
 
 		 395 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  44.48 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  44.41 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1575  protein of unknown function DUF482  40.66 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.365702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4753  hypothetical protein  42.74 
 
 		 402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.51971 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  44.32 
 
 		 411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  41.42 
 
 		 392 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  43.57 
 
 		 392 aa  282  8.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0790  hypothetical protein  40.32 
 
 		 378 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  41.96 
 
 		 409 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0702  hypothetical protein  39.79 
 
 		 378 aa  279  6e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  41.6 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  43.7 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  43.2 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  45.07 
 
 		 381 aa  276  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  36.56 
 
 		 433 aa  276  4e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2533  hypothetical protein  40.56 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01036  hypothetical protein  42.13 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479769  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  39.28 
 
 		 416 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06130  hypothetical protein  42.13 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.187585  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0943  hypothetical protein  43.36 
 
 		 380 aa  272  9e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118065  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02848  hypothetical protein  39.37 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>