More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1181 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  100 
 
 
274 aa  557  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  68.25 
 
 
275 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  67.4 
 
 
275 aa  380  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  64.71 
 
 
277 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  66.91 
 
 
274 aa  378  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  68.61 
 
 
275 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  67.88 
 
 
275 aa  375  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  66.3 
 
 
276 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  66.55 
 
 
274 aa  371  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  65.09 
 
 
276 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  64.96 
 
 
274 aa  371  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  66.3 
 
 
276 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 
275 aa  367  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  66.67 
 
 
276 aa  369  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  66.06 
 
 
274 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  65.82 
 
 
275 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  64.23 
 
 
275 aa  364  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  64.71 
 
 
273 aa  365  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  65.22 
 
 
276 aa  365  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  63.87 
 
 
274 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 
276 aa  361  8e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  64.23 
 
 
274 aa  361  8e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 
276 aa  361  8e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 
276 aa  360  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 
276 aa  360  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 
276 aa  360  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 
276 aa  360  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 
276 aa  360  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 
276 aa  360  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 
276 aa  360  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  65.94 
 
 
276 aa  360  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 
276 aa  359  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  64.73 
 
 
275 aa  359  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  62.64 
 
 
280 aa  358  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 
275 aa  358  6e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  65.09 
 
 
275 aa  358  6e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  64.84 
 
 
276 aa  358  7e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  66.18 
 
 
276 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  64.13 
 
 
276 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  64.13 
 
 
276 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  65.09 
 
 
277 aa  355  5e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  65.09 
 
 
277 aa  355  5e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  64.84 
 
 
276 aa  355  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 
276 aa  354  8.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 
276 aa  354  8.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  65.2 
 
 
276 aa  353  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 
274 aa  353  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 
275 aa  352  4e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331539  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  63.37 
 
 
276 aa  351  7e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  64.23 
 
 
274 aa  350  1e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  62.13 
 
 
273 aa  350  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 
276 aa  350  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 
274 aa  349  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 
274 aa  348  6e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  65 
 
 
274 aa  343  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  61.59 
 
 
279 aa  344  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  63.64 
 
 
275 aa  344  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  63.37 
 
 
274 aa  343  1e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  62.27 
 
 
274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  61.59 
 
 
277 aa  341  5.999999999999999e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0289  50S ribosomal protein L2  61.9 
 
 
279 aa  341  9e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 
277 aa  340  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  61.9 
 
 
274 aa  338  5e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  60.51 
 
 
277 aa  338  5.9999999999999996e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  62.72 
 
 
282 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
273 aa  337  9e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  61.17 
 
 
276 aa  337  9e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 
277 aa  336  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 
277 aa  336  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0062  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 
276 aa  335  3.9999999999999995e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000124196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  60.22 
 
 
275 aa  335  7e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0590  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 
278 aa  333  1e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.886345 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1872  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 
276 aa  333  2e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.701919  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1282  ribosomal protein L2  61.45 
 
 
275 aa  333  2e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1701  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 
276 aa  333  3e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 
283 aa  332  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3432  ribosomal protein L2  63.74 
 
 
278 aa  332  4e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2078  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 
276 aa  331  7.000000000000001e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000477294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  59.63 
 
 
279 aa  331  8e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 
277 aa  330  1e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1229  50S ribosomal protein L2  59.85 
 
 
275 aa  330  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624705  unclonable  0.0000121783 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1029  50S ribosomal protein L2  60.22 
 
 
277 aa  330  1e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000494173  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 
277 aa  330  1e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  58.18 
 
 
278 aa  329  3e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  59.85 
 
 
276 aa  328  6e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2643  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 
277 aa  328  7e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.331406  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0309  50S ribosomal protein L2  63 
 
 
278 aa  328  8e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 
277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0352  50S ribosomal protein L2  59.49 
 
 
277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000147687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3140  50S ribosomal protein L2  63.14 
 
 
278 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.524365  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  59.06 
 
 
279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1936  50S ribosomal protein L2  57.14 
 
 
282 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0711  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 
275 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.876488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1943  50S ribosomal protein L2  57.14 
 
 
282 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2656  ribosomal protein L2  62.41 
 
 
278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2021  50S ribosomal protein L2  57.14 
 
 
282 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  59.42 
 
 
277 aa  327  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  0.0000130499 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23780  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 
278 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0630  ribosomal protein L2  62.77 
 
 
278 aa  325  4.0000000000000003e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1914  50S ribosomal protein L2  58.24 
 
 
282 aa  325  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>